结论：公司实行7小时工作制，超过7小时的部分能否算作加班，这主要取决于劳动合同、公司规章制度以及实际工作情况，一般情况下，超出7小时的部分可以认定为加班，但具体还需结合以下因素综合判断。
一、劳动合同与公司规章制度
劳动合同约定：首先，要查看劳动合同中是否明确规定了工作时间和加班的相关条款。如果劳动合同中明确规定了每天工作7小时，且未提及加班或加班工资的计算方式，那么超出7小时的部分，在符合加班条件的情况下，应当被认定为加班。
公司规章制度：其次，公司规章制度也是判断加班的重要依据。如果公司规章制度中明确规定了加班的认定标准和加班工资的计算方式，那么应当按照规章制度执行。但需要注意的是，公司规章制度不能违反法律法规的强制性规定，否则无效。
二、实际工作情况
加班事实：要认定加班，必须存在实际的加班事实。即员工在超出规定工作时间后，仍然在工作岗位上从事工作。这需要有相应的证据支持，如考勤记录、工作记录等。
加班必要性：并非所有超出7小时的工作时间都能被认定为加班。如果是因为员工个人原因（如工作效率低下、拖延时间等）导致的工作时间延长，那么这部分时间通常不被认定为加班。加班应当是基于工作需要，且经过公司同意或认可的。
三、法律法规依据
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果公司实行7小时工作制，但员工实际工作时间超过了8小时（在考虑合理休息时间后），或者每周累计工作时间超过了44小时，那么超出部分应当被认定为加班，公司应当支付加班工资或安排补休。
四、建议与注意事项
保留证据：员工在加班时，应当保留好相关证据，如考勤记录、工作记录、加班申请单等，以便在需要时证明自己的加班事实。
与公司沟通：如果员工认为自己的加班时间未得到合理补偿，可以与公司进行沟通协商，要求公司支付加班工资或安排补休。
寻求法律援助：如果与公司沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
举例说明：假设某员工与公司签订的劳动合同中明确规定了每天工作7小时，且公司规章制度中也未对加班有特别规定。某周，该员工因工作需要，连续三天每天工作了9小时。那么，这三天中每天超出的2小时，在符合加班条件的情况下，应当被认定为加班，公司应当支付相应的加班工资或安排补休。
总结：公司实行7小时工作制，超过7小时的部分能否算作加班，需要综合考虑劳动合同、公司规章制度、实际工作情况以及法律法规的规定。员工在加班时应当保留好相关证据，并与公司进行沟通协商，必要时可以寻求法律援助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。