结论前置：给员工做假工资被申诉后，税务局很可能会进行罚款，具体分析如下：

1. 从税务违法性角度：
   • 企业给员工做假工资，通常涉及虚报工资薪金支出。根据税收相关法律法规，企业应当如实核算和申报工资薪金等成本费用。虚报工资属于编造虚假计税依据的行为，这直接违反了税收征管的规定。
   • 例如，企业为了少缴纳企业所得税，通过做假工资的方式虚增成本，减少应纳税所得额，这种行为破坏了税收征管的公平性和严肃性，税务机关一旦查实，必然会依据相关法律进行处罚。
2. 从罚款依据角度：
   • 《中华人民共和国税收征收管理法》第六十四条规定，纳税人、扣缴义务人编造虚假计税依据的，由税务机关责令限期改正，并处五万元以下的罚款。所以，企业给员工做假工资被申诉后，税务机关有权依据此条款对企业进行罚款。
   • 如果企业的这种虚假申报行为情节严重，还可能面临更严厉的处罚。比如，若涉及偷逃税款数额较大，除了罚款外，还可能构成逃税罪，需要承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第二百零一条规定，纳税人采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或者不申报，逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
3. 从实际执法角度：
   • 税务局在日常的税务检查和稽查工作中，对于企业的工资薪金申报情况会进行严格审查。一旦接到关于企业做假工资的申诉，会启动调查程序，通过查阅企业的财务账簿、工资发放记录、银行流水等资料，核实工资申报的真实性。
   • 如果查实企业存在做假工资的行为，会根据违法情节的轻重，依法作出罚款等处理决定。而且，这种不良记录还会影响企业的纳税信用等级评定，给企业带来更多的负面影响，如限制发票领用、限制出口退税等。

建议：企业应当严格遵守税收法律法规，如实申报工资薪金等成本费用，避免因做假工资而面临税务罚款等法律风险。如果企业已经存在此类问题，建议尽快主动向税务机关说明情况，配合调查，争取从轻处理。要是你还有其他关于税务法律方面的问题，可以直接向我咨询。