结论：员工在工伤且承担交通事故次要责任的情况下，用人单位需赔付的费用主要包括治疗工伤期间的工资福利、停工留薪期内的原工资福利待遇、一次性伤残补助金（如构成伤残）、以及可能的一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金（如解除或终止劳动关系时构成伤残）。同时，若用人单位未依法缴纳工伤保险费，则需承担全部工伤保险待遇的支付责任。
详细分析：
治疗工伤期间的工资福利：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，员工在工伤治疗期间，用人单位应支付其工资福利。这是为了保障员工在治疗期间的基本生活需求，确保其能够安心治疗，早日康复。
停工留薪期内的原工资福利待遇：
- 停工留薪期是指员工因工伤需要暂停工作接受治疗的期间。在此期间，用人单位应按原工资福利待遇支付员工工资。停工留薪期的具体时长通常根据医疗机构的证明和当地的相关规定来确定。
一次性伤残补助金：
- 如果员工因工伤构成伤残，根据伤残等级，用人单位或工伤保险基金应支付一次性伤残补助金。伤残等级越高，补助金数额越大。这一补助金旨在补偿员工因伤残而遭受的长期损失。
一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金：
- 当员工与用人单位解除或终止劳动关系时，如果其因工伤构成伤残，用人单位或工伤保险基金还应支付一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。这两项补助金旨在帮助员工在离职后更好地应对医疗和就业方面的挑战。
用人单位未依法缴纳工伤保险费的责任：
- 如果用人单位未依法为员工缴纳工伤保险费，那么当员工发生工伤时，用人单位需承担全部工伤保险待遇的支付责任。这包括上述提到的所有费用，以及可能产生的其他与工伤相关的费用。
特殊情况说明：
- 在交通事故中承担次要责任并不影响员工享受工伤保险待遇。工伤保险实行无过错责任原则，即无论员工在交通事故中是否承担责任，只要其因工作原因受到伤害，就应享受工伤保险待遇。
- 如果员工同时获得了交通事故赔偿和工伤保险待遇，对于某些重复的项目（如医疗费），员工可能无法重复获得赔偿。但具体规定可能因地区而异，需根据当地的相关法律法规来确定。
建议与行动：
- 作为员工，在发生工伤后应及时向用人单位报告，并尽快进行工伤认定和伤残等级鉴定。
- 用人单位应积极配合员工进行工伤认定和伤残等级鉴定，并按照规定支付相关费用。
- 如果双方在工伤赔偿方面存在争议，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来解决。
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