集体企业员工职务补贴高于工资是否合法，需分情况讨论，关键在于补贴性质、发放依据及是否符合法律法规和集体企业章程规定。具体分析如下：

1. 若职务补贴属于合法薪酬组成部分，且符合集体企业薪酬制度及法律法规规定，则合法
   职务补贴通常是企业根据员工岗位性质、职责、工作条件等因素发放的额外报酬，属于薪酬体系的一部分。根据《劳动法》第四十七条，用人单位有权根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。因此，集体企业若通过民主程序（如职工代表大会审议）制定薪酬制度，明确职务补贴的发放标准、范围及条件，且该制度不违反《劳动法》《劳动合同法》等强制性规定（如最低工资标准、同工同酬原则），则职务补贴高于工资是合法的。
   例如：某集体企业规定，技术岗位员工因需承担高风险作业，每月发放5000元职务补贴，而基本工资为3000元。若该制度经职工代表大会通过，且补贴发放与岗位风险匹配，则合法。

2. 若职务补贴缺乏合法依据或违反法律法规，则不合法

   • 违反最低工资标准：根据《劳动法》第四十八条，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。若职务补贴与工资合并计算后仍低于最低工资，则违法。
     
   • 违反同工同酬原则：根据《劳动法》第四十六条，工资分配应遵循同工同酬原则。若职务补贴的发放存在性别、年龄、身份等歧视性因素（如仅向特定关系人发放），则违法。
     
   • 未履行民主程序：集体企业的薪酬制度需经职工代表大会或全体职工讨论通过。若职务补贴的发放未经过民主程序，可能因程序违法而被认定无效。
     
   • 以补贴名义规避税费或社保：若企业将本应计入工资的部分以职务补贴名义发放，以减少税费或社保缴纳，则涉嫌违法。
     例如：某集体企业未通过民主程序，擅自规定管理层每月发放1万元职务补贴，而普通员工无补贴，且补贴发放与岗位无关，仅因身份差异，则可能违反同工同酬原则。

3. 集体企业章程或内部规定对职务补贴的特别限制
   若集体企业章程或内部规章制度对职务补贴的发放有特别规定（如补贴上限、发放条件等），则需优先遵守内部规定。若内部规定与法律法规冲突，则以法律法规为准。
   例如：某集体企业章程规定，职务补贴不得超过工资的50%。若企业实际发放的补贴超过该比例，则违反内部规定，但需进一步判断是否违反法律法规（如最低工资标准）。

建议：

• 对集体企业而言，应通过民主程序制定合法的薪酬制度，明确职务补贴的发放标准、范围及条件，并确保不违反法律法规。
  
• 对员工而言，若对职务补贴的合法性有疑问，可要求企业提供薪酬制度依据，或向当地劳动监察部门投诉。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案例为您详细分析。