针对您提出的“完工后发现未按规定设立工人工资支付专户应该如何整改”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、立即认识错误并启动整改程序
首先，您需要明确认识到未按规定设立工人工资支付专户是违反《保障农民工工资支付条例》的行为，这可能会对您单位造成严重的法律后果，包括项目停工、罚款以及信用惩戒等。因此，一旦发现此问题，应立即启动整改程序，确保尽快纠正错误。
二、具体整改步骤
开设工资专用账户：
- 您需要尽快与银行联系，按照相关规定开设农民工工资专用账户。
- 确保账户名称、用途等符合法规要求，并妥善保管相关开户资料。
补存工资款项：
- 如果项目已经完工，但之前未通过专用账户支付工资，您需要将应支付的工资款项补存至新开设的专用账户中。
- 确保工资款项的足额和及时支付，以维护农民工的合法权益。
完善工资支付记录：
- 您需要建立完善的工资支付记录系统，记录每位农民工的工资支付情况，包括支付时间、支付金额、支付方式等。
- 这些记录将作为您单位遵守法规、保障农民工工资支付的重要证据。
提交整改报告：
- 在完成上述整改步骤后，您需要向相关部门（如人力资源社会保障行政部门、相关行业工程建设主管部门）提交整改报告。
- 报告中应详细说明整改情况、补存工资款项的金额和支付情况、以及未来保障工资支付的措施等。
三、应对可能的处罚
接受责令限期改正：
- 相关部门在收到您的整改报告后，可能会对您单位进行责令限期改正的处理。
- 您需要积极配合相关部门的工作，按照要求完成整改，并确保今后不再出现类似问题。
准备应对逾期未改正的处罚：
- 如果您未能在规定期限内完成整改，相关部门可能会采取更严厉的处罚措施，如项目停工、罚款等。
- 因此，您需要确保整改工作的及时性和有效性，以避免不必要的损失。
关注信用惩戒：
- 未按规定设立工资支付专户还可能受到信用惩戒，影响您单位的市场声誉和未来业务机会。
- 因此，您需要重视信用建设，积极履行社会责任，树立良好的企业形象。
四、总结与建议
为了避免类似问题的再次发生，我建议您单位在今后的项目中严格遵守《保障农民工工资支付条例》的相关规定，确保农民工工资的按时足额支付。同时，加强内部管理，建立完善的工资支付制度和监督机制，确保各项规定得到有效执行。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时与我联系。