超市销售保健食品未按规定分区，主要会面临行政处罚，具体处罚措施及依据如下：
一、行政处罚的法律依据
根据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定，食品经营者应当按照食品安全标准的要求，将食品与非食品、生食与熟食等分开存放，确保食品安全。保健食品作为特殊食品，其销售更应遵循严格的管理规定，包括分区销售等要求。若超市未按规定分区销售保健食品，将可能面临市场监督管理部门的行政处罚。
二、可能的行政处罚措施
警告：
- 对于初次违规或情节较轻的超市，市场监督管理部门可能会先给予警告，要求其立即改正未按规定分区销售保健食品的行为。
罚款：
- 若超市未在规定期限内改正或违规情节较为严重，市场监督管理部门将依据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定，对超市处以罚款。罚款的具体数额将根据违规情节的严重程度、超市的规模以及是否造成实际危害等因素综合确定。一般来说，罚款数额可能从几千元到数万元不等，具体数额需由市场监督管理部门根据实际情况裁量。
没收违法所得：
- 如果超市通过未按规定分区销售保健食品获得了违法所得，市场监督管理部门还将依法没收这些违法所得。
责令停业整顿：
- 在违规情节特别严重或造成严重后果的情况下，市场监督管理部门可能会责令超市停业整顿，直至其符合食品安全管理要求为止。
三、实际案例与法律建议
实际案例：
- 曾有超市因未按规定分区销售保健食品，被市场监督管理部门查处并处以罚款。该超市在接到警告后未及时改正，最终面临了更严厉的处罚。
法律建议：
- 超市应严格遵守《中华人民共和国食品安全法》等相关法律法规的规定，确保保健食品等特殊食品的销售符合分区管理要求。
- 超市应定期对员工进行食品安全培训，提高员工的食品安全意识和法律意识，避免因违规操作而面临行政处罚。
- 若超市收到市场监督管理部门的警告或处罚决定，应立即采取措施进行整改，并在规定期限内完成整改工作，以避免更严厉的处罚。
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