结论：行政拘留三天公司不一定会发现，这主要取决于公司是否进行相关查询以及拘留信息是否被公开或记录在个人档案中。
分析：
公司查询情况：
- 一般情况下，公司不会主动查询员工的行政拘留记录，除非该记录与员工的工作职责、公司利益或法律法规有直接关联。例如，如果员工因违法行为被拘留，且该行为与公司业务或声誉有关，公司可能会进行查询。
- 如果公司有严格的背景调查政策，或者员工在入职时签署了相关授权文件，允许公司查询其个人记录，那么公司可能会发现员工的行政拘留记录。
拘留信息公开与记录：
- 行政拘留记录通常不会公开，除非涉及特定情况（如严重违法犯罪、危害国家安全等），或者根据法律法规需要公开。
- 拘留记录可能会被记录在个人档案中，但这取决于具体的法律法规和拘留机关的政策。如果记录被存入个人档案，且公司有权查阅该档案，那么公司可能会发现。
员工告知义务：
- 员工没有主动告知公司其被行政拘留的义务，除非公司规章制度或劳动合同中有明确规定。
- 如果员工选择不告知公司，且公司没有通过其他途径发现，那么公司可能永远不会知道员工被行政拘留的情况。
建议：
- 对于员工：如果担心行政拘留记录对公司产生影响，可以主动与公司沟通，解释情况，并寻求公司的理解和支持。同时，也可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及如何应对可能的法律后果。
- 对于公司：如果希望了解员工的背景情况，可以在入职时进行严格的背景调查，并要求员工签署相关授权文件。同时，公司也应制定明确的规章制度，规定员工在何种情况下需要告知公司其被行政拘留的情况。
可能的法律后果：
- 如果员工因违法行为被行政拘留，且该行为违反了公司的规章制度或法律法规，公司可能会根据相关规定对员工进行处理，如警告、罚款、解雇等。
- 如果员工未告知公司其被行政拘留的情况，且该情况对公司造成了损失或不良影响，公司可能会追究员工的法律责任。
总之，行政拘留三天公司不一定会发现，这取决于多种因素。如果你有任何具体的法律问题或担忧，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。