公司发现员工个人证件造假时，应立即采取以下措施，具体处理方式需结合造假性质、公司制度及法律规定综合判断：

1. 内部调查与证据固定

   • 立即暂停该员工的工作权限，避免其继续利用虚假证件从事可能损害公司利益的行为。
     
   • 收集造假证据（如伪造的证件复印件、与原件比对记录、员工入职时提交的材料等），必要时可委托第三方机构进行鉴定。
     
   • 核查公司《员工手册》或相关制度中是否明确规定“证件造假属于严重违纪行为”，以及对应的处理条款（如解除劳动合同、追偿损失等）。

2. 分情况处理

   • 若造假证件涉及入职核心条件（如学历、职业资格证书、身份证明等）：
     根据《劳动合同法》第39条，公司可直接解除劳动合同，且无需支付经济补偿。但需注意：
     
     • 制度中需明确将“证件造假”列为“严重违反规章制度”的情形；
       
     • 解除程序需合法（如通知工会、送达解除通知等）。
       
   • 若造假证件与工作无直接关联（如虚构婚姻状况、健康证明等）：
     公司可依据制度给予警告、扣减绩效等处分，但直接解除劳动合同可能被认定为违法，需谨慎处理。
     
   • 若造假行为涉嫌违法（如伪造国家机关证件）：
     公司应立即向公安机关报案，并配合调查。同时，可依据《劳动合同法》第39条以“被依法追究刑事责任”为由解除合同。

3. 后续风险防范

   • 完善入职审查流程：要求员工签署《诚信承诺书》，明确造假责任；通过学信网、职业资格网站等官方渠道核验证件真实性。
     
   • 制度合法性审查：确保《员工手册》中关于“证件造假”的条款经民主程序制定，并向员工公示。
     
   • 损失追偿：若造假行为导致公司损失（如招聘成本、培训费用等），可依据《民法典》第1165条要求员工赔偿，但需举证损失与造假行为的因果关系。

示例：
某公司发现员工伪造本科学历入职，但实际工作能力达标。此时公司仍可解除合同，因学历造假直接违反入职条件及制度规定；若员工仅虚报婚姻状况，则解除合同可能被认定为违法。

如有具体场景或证据材料，可进一步向我咨询，我会结合细节为您分析处理方案。