结论前置：关于“甲方根据公司效益、乙方工作表现及当地工资指导线等可调整工资，合同是否合法”这一问题，合同条款本身并不必然违法，但其合法性取决于具体内容、调整程序以及是否违反法律法规的强制性规定。以下从多个角度进行详细分析：
一、合同条款的合法性基础
意思自治原则：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。在合同中，双方有权就工资、福利等劳动条件进行协商并达成一致。
- 因此，如果合同中明确约定了甲方可以根据公司效益、乙方工作表现及当地工资指导线等因素调整工资，且这一约定是双方真实意思的表示，没有违反法律法规的强制性规定，那么该条款在形式上是合法的。
合理性审查：
- 尽管合同条款在形式上可能合法，但其内容必须合理。合理性审查主要关注调整工资的依据是否充分、调整程序是否公正透明、调整幅度是否合理等。
- 例如，如果甲方仅凭主观判断或未经合理程序就随意调整乙方工资，且调整幅度过大，那么这种调整可能被视为不合理，从而损害乙方的合法权益。
二、调整工资的合法程序
协商一致原则：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。
- 因此，如果甲方希望调整乙方工资，应当与乙方进行协商，并达成一致意见。未经协商一致，甲方不得单方面调整乙方工资。
民主程序与公示程序：
- 如果甲方制定的工资调整方案涉及劳动者切身利益，如集体工资调整等，那么根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，甲方应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定，并将方案进行公示或者告知劳动者。
- 这一程序确保了工资调整方案的民主性和透明性，有助于保护劳动者的合法权益。
三、调整工资的合法性限制
不得低于最低工资标准：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，国家实行最低工资保障制度。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
- 因此，如果甲方调整后的工资低于当地最低工资标准，那么这种调整是违法的。
不得违反法律法规的强制性规定：
- 除了最低工资标准外，还有其他法律法规对工资支付、调整等进行了规定。例如，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资等。
- 如果甲方在调整工资时违反了这些强制性规定，那么这种调整也是违法的。
四、实际案例与建议
- 实际案例：在实际操作中，因工资调整引发的劳动纠纷屡见不鲜。例如，某公司因经营不善决定降低员工工资，但未经与员工协商一致且未履行民主程序与公示程序，最终被法院认定为违法调整工资，需补发员工工资差额并支付经济补偿。
- 建议：为了避免因工资调整引发的劳动纠纷，建议甲方在调整工资时遵循以下原则：一是确保调整依据充分、合理；二是与乙方进行充分协商并达成一致意见；三是履行民主程序与公示程序（如涉及集体工资调整）；四是确保调整后的工资不低于当地最低工资标准且不违反法律法规的强制性规定。
总结：合同中约定甲方可以根据公司效益、乙方工作表现及当地工资指导线等因素调整工资，在形式上并不必然违法。但其合法性取决于具体内容、调整程序以及是否违反法律法规的强制性规定。因此，在签订和履行此类合同时，双方应谨慎对待并遵循相关法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。