结论：在同等责任事故中，医药费是否需要扣除交强险后再对半分，取决于医药费是否超出交强险的医疗费用赔偿限额。若未超出，则由交强险全额赔偿；若超出，则超出部分由事故双方按照责任比例分担，在同等责任下，通常是对半分担。
详细分析：
交强险范围内的赔偿：
- 根据《机动车交通事故责任强制保险条例》的规定，被保险机动车发生道路交通事故造成第三者人身伤亡时，保险公司应在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。其中，医疗费用赔偿限额通常为1.8万元（具体限额可能因地区和政策调整而有所不同，请以当地最新政策为准）。
- 这意味着，无论事故责任如何划分，只要医药费不超过交强险的医疗费用赔偿限额，这部分费用都可以由交强险全额赔偿，无需事故双方再按责任比例分担。
超出交强险部分的赔偿：
- 当医药费超出交强险医疗费用赔偿限额时，超出的部分就需要由事故双方按照责任比例进行分担。
- 在同等责任的情况下，如果双方都是机动车，那么各自承担50%的责任是常见的做法。也就是说，超出交强险部分的医药费，双方各承担一半。
- 如果一方是机动车，另一方是非机动车驾驶人或者行人，那么机动车一方可能会承担更多的赔偿责任，具体比例需根据当地法律法规和实际情况确定。但即便如此，在确定机动车一方的赔偿责任时，仍然会先扣除交强险的赔偿限额。
商业险的赔付：
- 如果事故双方都购买了商业第三者责任险，那么各自应承担的超出交强险部分的费用，还可以根据保险合同的约定，由商业险进行赔偿。
- 商业险的赔偿金额和比例会依据保险合同的具体条款来确定，可能包括免赔率、赔偿限额等因素。因此，在购买商业险时，建议仔细阅读保险合同，了解清楚保险条款和赔偿范围。
法律建议：
- 在处理同等责任事故中的医药费赔偿问题时，建议首先了解各自的保险政策，明确赔偿范围和限额。
- 根据事故责任和实际花费进行协商，尽量达成和解协议，以减少诉讼成本和时间。
- 如果协商不成，可以寻求法律援助或通过法律途径来维护自己的合法权益。在诉讼过程中，需要提供充分的证据来证明自己的损失和对方的责任。
举例说明：
假设一起同等责任事故中，受害者的医药费总额为2万元。其中，交强险的医疗费用赔偿限额为1.8万元。那么，在这起事故中：
- 交强险将首先赔偿1.8万元给受害者。
- 剩下的2000元医药费，将由事故双方按照责任比例分担。在同等责任下，双方各承担1000元。
如果有问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。