员工因病辞职，公司一般不应扣工资，但在特定情况下可能涉及工资的调整或补偿问题。以下是对这一问题的详细分析：
一、公司不应扣工资的情况
正常辞职流程：
- 如果员工因病提出辞职，并且按照公司规定的流程办理了离职手续，公司应当按照劳动合同的约定支付员工应得的工资。
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
医疗期内的保护：
- 如果员工在医疗期内提出辞职，公司同样不能克扣工资。医疗期是指员工因患病或非因工负伤停止工作治病休息，而用人单位不得因此解除劳动合同的期限。
- 在医疗期内，公司应当按照劳动合同的约定支付病假工资或疾病救济费，且该费用不得低于当地最低工资标准的80%。
二、公司可能调整工资或涉及补偿的情况
未提前通知或工作交接问题：
- 如果员工因病急辞工，未提前通知公司或未完成工作交接，给公司造成损失的，公司可以依据规章制度要求员工承担部分损失。但这种扣除应当合理，且不能违反劳动法的规定。
- 扣除金额的限制：扣除的工资金额应与实际造成的损失相当，不能随意克扣。例如，若员工未提前通知离职导致公司需要临时招聘新员工或支付加班费来填补空缺，公司可以要求员工承担部分或全部费用，但扣除的金额应合理。
劳动合同中的特别约定：
- 如果劳动合同中有特别约定，如员工在特定情况下辞职需支付违约金或赔偿金，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能根据约定调整工资或要求员工支付补偿。
- 但需注意：根据《中华人民共和国劳动合同法》，仅以下两种情况可约定违约金：一是单位提供专项培训费用并约定服务期，劳动者提前离职需按比例赔偿；二是劳动者违反竞业限制协议。因病辞职通常不属于上述情形，故一般无需支付违约金。
医疗期满后的处理：
- 如果员工医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作，公司可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后解除劳动合同，并需按员工在本单位工作的年限支付经济补偿金。
- 经济补偿金的计算：按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
三、建议与行动
与公司协商：
- 如果员工因病辞职后遇到工资问题，首先建议与公司进行协商，明确工资未发放或调整的原因，并尝试达成共识。
收集证据：
- 如果协商无果，员工应收集并保留相关证据，如劳动合同、工资条、银行流水、医疗证明、辞职申请及审批记录等，以备后续维权之需。
寻求法律援助：
- 如果公司无正当理由克扣工资或拒绝支付经济补偿金，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
总结来说，员工因病辞职时，公司一般不应扣工资。但在特定情况下，如未提前通知、工作交接问题或劳动合同中的特别约定等，公司可能调整工资或要求员工支付补偿。如果员工遇到工资问题，建议首先与公司协商，并收集相关证据以备维权之需。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。