核心结论：仅有股东无法成立工会，因此不存在直接通过工会申请返还相关款项的途径。但可根据具体款项性质，通过其他合法方式申请返还，以下分情况说明：

1. 若款项为工会经费且尚未拨付
   根据《工会法》及《中国工会章程》，工会经费的拨付主体是用人单位（企业），而非股东个人。若企业尚未将依法计提的工会经费拨付至工会账户（或上级工会），股东作为个人无权直接申请返还。此时需明确：

   • 若企业未成立工会，经费应按比例上缴上级工会（如地方总工会），由上级工会代管并返还部分用于企业职工活动。股东可推动企业完成工会组建或直接联系上级工会，说明企业未成立工会的实际情况，申请按程序返还代管经费。
     
   • 若企业已注销或终止经营，剩余工会经费需根据《工会法》第四十五条，由上级工会监督处理，股东个人无权主张返还。

2. 若款项为股东误缴或代垫的“工会相关费用”
   若股东误将个人资金作为“工会经费”缴纳，或代企业垫付了本应由企业承担的工会相关费用（如活动经费、福利费用等），可依据《民法典》中“不当得利”或“无因管理”的规定申请返还：

   • 不当得利：若企业无合法依据收取股东款项（如误缴），股东可要求企业返还，并保留转账记录、沟通记录等证据。
     
   • 无因管理：若股东代企业垫付费用，可要求企业偿还必要支出及利息，需提供垫付凭证（如发票、合同）及企业认可的证明（如书面确认函）。
     
   • 程序建议：优先与企业协商，协商不成可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁（若涉及劳动关系），或直接向法院提起民事诉讼。

3. 若款项涉及企业与工会之间的历史纠纷
   若股东同时是企业原管理层，且涉及企业与工会之间的历史经费纠纷（如工会经费计提不足、挪用等），需区分主体责任：

   • 工会经费纠纷的主体是企业和工会，股东个人非适格主体，无法直接申请返还。
     
   • 若股东认为企业或工会存在违法行为（如侵占经费），可向工会上级组织或劳动监察部门举报，由相关部门介入调查并追责，但返还对象仍是企业或工会，而非股东个人。

温馨提示：工会经费的拨付、使用及返还有严格的法定程序，建议根据具体款项性质，结合企业现状（是否存续、是否成立工会等），选择合法途径主张权利。如有进一步疑问或需协助梳理证据，可直接向我咨询。