针对您提出的“员工线下申请工伤认定，但老板和人社局有关系怎么办”的问题，我可以明确告诉您，工伤认定的程序是客观公正、依法进行的，不会因为老板与人社局的关系而受到影响。以下是我为您详细梳理的工伤认定流程及相关保障措施：
一、工伤认定流程
申请提出：
- 职工发生事故伤害或者被诊断、鉴定为职业病后，所在单位应在30日内向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 若单位未按时申请，受伤害职工或其近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，直接提出工伤认定申请。
材料提交：
- 申请时需填写《工伤认定申请表》，并提交劳动、聘用合同文本复印件或与用人单位存在劳动关系的其他证明材料，以及医疗机构出具的受伤后诊断证明书或职业病诊断证明书。
审核受理：
- 社会保险行政部门收到申请后，会在15日内对材料进行审核。材料完整的，作出受理决定；不完整的，会书面告知需要补正的材料。
调查核实：
- 受理申请后，社会保险行政部门可根据需要对证据进行调查核实，调查工作由两名以上工作人员共同进行，并出示执行公务的证件。
- 调查核实过程中，有关单位和个人应予以协助，据实提供情况和证明材料。
认定决定：
- 社会保险行政部门应在受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定决定，并出具《认定工伤决定书》或《不予认定工伤决定书》。
- 若事实清楚、权利义务明确，可在15日内作出认定决定。
送达与保存：
- 认定决定作出后，社会保险行政部门应在20日内将决定书送达受伤害职工（或其近亲属）和用人单位，并抄送社会保险经办机构。
- 工伤认定的有关资料将保存50年。
二、保障措施
客观公正原则：
- 工伤认定程序严格遵循客观公正原则，确保认定结果的公正性和准确性。
回避制度：
- 若社会保险行政部门工作人员与工伤认定申请人有利害关系，应当回避，以避免利益冲突影响认定结果。
举证责任：
- 若职工或其近亲属认为是工伤，而用人单位不认为是工伤的，由用人单位承担举证责任。用人单位拒不举证的，社会保险行政部门可根据受伤害职工提供的证据或调查取得的证据依法作出认定决定。
法律救济途径：
- 若职工或其近亲属、用人单位对不予受理决定或工伤认定决定不服的，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，通过法律途径维护自身权益。
三、针对您担忧的问题
- 老板与人社局的关系不会影响工伤认定：工伤认定程序严格依法进行，不受任何外部因素干扰。社会保险行政部门在认定过程中会保持客观公正，确保认定结果的准确性和公正性。
- 您有权依法申请工伤认定：无论老板与人社局是否存在关系，您都有权依法提出工伤认定申请，并按照规定的程序进行申请和认定。
综上所述，您可以放心地按照规定的程序提出工伤认定申请。在申请过程中，如有任何疑问或需要帮助，可随时咨询当地的社会保险行政部门或寻求法律援助。