将农业用地出租给第三方用于盖厂房所签的租赁合同，一般情况下是无效的。以下是从不同角度的详细分析：

1. 土地用途管制原则：

   • 根据我国相关法律法规，农业用地是专门用于农业生产的土地，其用途受到严格管制。将农业用地改变为非农业用途（如建设厂房）需要经过相关部门的批准和变更登记手续。
   • 如果未经批准擅自改变土地用途，并基于此签订租赁合同，该合同可能因违反法律强制性规定而无效。

2. 租赁合同的有效性要件：

   • 租赁合同的有效性要求合同双方具有相应的民事行为能力，合同内容合法，且不违反法律、行政法规的强制性规定。
   • 在本案例中，由于租赁合同的内容涉及将农业用地用于非农业用途，这违反了土地用途管制原则，因此合同内容不合法，导致合同无效。

3. 可能的法律后果：

   • 如果租赁合同被认定为无效，那么双方基于该合同所取得的财产应当予以返还。对于因合同无效而造成的损失，双方可能需要根据各自的过错程度承担相应的赔偿责任。
   • 此外，擅自改变土地用途还可能面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。

4. 特殊情况下的有效性探讨：

   • 尽管一般情况下将农业用地出租用于盖厂房的租赁合同是无效的，但如果存在特殊情况，如政府已经批准了土地用途的变更，并且双方已经按照相关规定办理了相关手续，那么该租赁合同可能是有效的。
   • 然而，这种情况需要严格的法律程序和证据支持，不是普遍现象。

建议：

• 在签订租赁合同前，务必了解并遵守相关法律法规，确保土地用途的合法性。
• 如果确实需要将农业用地用于非农业用途，应先向相关部门申请变更土地用途，并办理相关手续。
• 在签订租赁合同时，应明确约定土地用途、租赁期限、租金支付方式等条款，并咨询专业律师以确保合同的合法性和有效性。

如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的解答。