结论：在交通事故中，对方全责并垫付了医疗费的情况下，出院时的总发票原则上应由伤者（即您母亲）持有，但具体处理方式还需根据双方协商及后续理赔需求来确定。

详细分析：

1. 发票的归属原则：

   • 发票作为医疗费用的直接证据，是伤者向保险公司或责任方主张赔偿的重要依据。因此，从法律角度和理赔实践来看，发票原则上应由伤者持有，以便其能够顺利地进行后续的理赔申请。

2. 对方垫付医疗费的情况：

   • 在对方全责并垫付了医疗费的情况下，对方可能希望获得发票以作为其已履行赔偿义务的证明。然而，这并不意味着发票必须直接交给对方。伤者可以在保留发票原件的同时，向对方提供发票的复印件或扫描件，以满足其证明需求。

3. 后续理赔的需求：

   • 如果伤者计划通过保险公司进行理赔，那么发票原件将是必不可少的材料。在这种情况下，伤者应确保发票原件的安全，并在提交理赔申请时一并附上。
   • 如果对方也希望通过其保险公司进行理赔（例如，对方车辆有车险），那么双方可以协商由伤者提供发票复印件给对方，同时保留原件以备自己理赔之需。或者，在对方保险公司同意的情况下，伤者可以直接将发票原件交给对方保险公司进行理赔，但这种情况较为少见，且需要双方充分信任和明确约定。

4. 双方协商的重要性：

   • 在处理发票归属问题时，双方应充分沟通并协商达成一致意见。这有助于避免后续因发票问题产生的纠纷和不必要的麻烦。
   • 如果双方无法就发票归属达成一致意见，可以考虑寻求第三方调解或法律途径解决争议。

建议：

• 在出院前，与对方或对方保险公司沟通发票的归属问题，明确双方的需求和期望。
• 保留发票原件，并根据需要提供复印件或扫描件给对方或对方保险公司。
• 如果双方无法就发票归属达成一致意见，可以考虑咨询专业律师或寻求第三方调解机构的帮助。

后续行动：

• 如果您在处理发票归属问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。