请年假领导不批准并扣工资，这一行为是否合法需根据具体情况判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、法律规定与合同约定
《中华人民共和国劳动法》规定：
- 劳动者享有带薪年休假，具体天数依据工作年限而定。例如，累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天等。
- 单位应保障职工享受年休假，且在批准年休假时，应主要考虑职工本人意愿，而非仅基于工作安排。
劳动合同或公司规章制度约定：
- 若劳动合同或公司规章制度中明确规定了年休假的申请流程和条件，员工需按此执行。但任何规定均不得违反法律法规的强制性要求，即不得剥夺员工依法享有的年休假权利。
二、领导不批准年假并扣工资的合法性分析
无正当理由拒绝并扣工资违法：
- 若员工符合年休假条件且已按规定流程提出申请，单位无正当理由拒绝，并扣减工资，则构成违法。此时，劳动行政部门可责令单位整改；逾期不改的，除支付未休假工资报酬外，单位还需加付赔偿金。
特殊情形下的合法性：
- 在特定紧急任务或不可抗力导致无法安排年休假的情况下，单位可暂缓批准年假，但需与员工协商并说明原因。此类情况需严格限定范围，避免滥用。同时，即使因特殊原因暂缓批准年假，单位也不应扣减员工工资。
程序性瑕疵的影响：
- 若单位以“未提前申请”等非法定理由拒绝年假申请，并扣减工资，可能因程序问题引发争议。但只要员工最终符合条件并完成流程，单位仍应承担法律责任，即支付未休假工资报酬，并不得扣减工资。
三、应对措施与建议
保留证据：
- 员工应保存请假申请记录、沟通邮件、短信等证据，以便在后续维权时提供依据。
协商解决：
- 优先通过内部沟通解决分歧。员工可以与领导或人力资源部门进行协商，说明自己的年休假权利和单位应承担的义务。
法律途径：
- 若协商未果，员工可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自身权益。在投诉或仲裁过程中，员工应提供充分的证据证明自己的年休假权利被侵犯，以及单位扣减工资的行为违法。
总结来说，请年假领导不批准并扣工资的行为，在无正当理由或违反法律规定的情况下是违法的。员工应了解自己的年休假权利，并在必要时采取法律措施维护自身权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。