结论：事业单位工龄41年的职工距离退休还有两年，单位一般不能强制其进行劳动能力鉴定并办理病退，除非符合特定法定条件且程序合法。以下从多个角度详细分析：
一、病退的法定条件
病退，即因病或非因工致残完全丧失劳动能力而提前退休，需满足以下条件：
完全丧失劳动能力：这是病退的核心条件。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》及相关劳动能力鉴定标准，职工必须经劳动能力鉴定委员会鉴定为完全丧失劳动能力。
达到法定退休年龄前的特定年限：虽然具体年限可能因地区和政策而异，但通常要求职工在达到法定退休年龄前一定年限内（如5年或10年）提出病退申请。不过，对于工龄较长的职工，如您所述的41年工龄，这一条件可能不是主要障碍，关键在于是否完全丧失劳动能力。
二、单位强制进行劳动能力鉴定的合法性
自愿原则：劳动能力鉴定通常应基于职工的自愿申请。单位不能单方面强制职工进行鉴定，除非职工的行为或健康状况已经严重影响到工作安全或单位正常运营，且单位有合理理由认为需要进行鉴定。
法定程序：即使单位认为有必要进行劳动能力鉴定，也应遵循法定程序，如与职工协商、提供必要的医疗证明等。未经职工同意或未遵循法定程序进行的鉴定，其结果可能不被认可。
三、单位强制病退的合法性及后果
非法强制的后果：如果单位未经职工同意或未遵循法定程序，强制职工进行劳动能力鉴定并办理病退，这可能构成违法行为。职工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求单位撤销非法决定并恢复工作关系。
合法病退的程序：如果职工确实符合病退条件且自愿申请病退，单位应协助职工办理相关手续，包括劳动能力鉴定、退休审批等。在此过程中，单位应确保程序的合法性和透明性，保障职工的合法权益。
四、建议与措施
与单位沟通：如果您认为单位的行为不合法或不合理，建议首先与单位进行沟通，明确表达您的意愿和诉求。尝试通过协商解决问题，避免不必要的法律纠纷。
寻求法律援助：如果沟通无果或单位坚持非法行为，您可以寻求法律援助或咨询专业律师（如我），了解您的权利和义务，以及可能的法律途径和救济措施。
保留证据：在整个过程中，务必保留好相关证据，如与单位的沟通记录、医疗证明、劳动能力鉴定报告等。这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。
最后，作为专注于劳动纠纷领域的律师，我建议您在面对此类问题时保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。