在申请劳动能力鉴定时，公司需要承担一定的配合义务，具体如下：
提供必要的材料：公司需要协助劳动者准备并提交劳动能力鉴定所需的材料，这些材料通常包括但不限于：
- 工伤认定决定书或职业病诊断证明书（如适用）；
- 劳动者的身份证明；
- 医疗机构的诊断证明、病历、检查报告等医疗资料；
- 其他可能需要的证明材料，如工作证明、工资单等，以证明劳动者与公司的劳动关系及受伤情况。
配合鉴定过程：
- 公司应确保劳动者能够按时参加劳动能力鉴定，包括提供必要的交通、时间等方面的支持；
- 在鉴定过程中，公司可能需要提供相关的证人证言或协助鉴定机构进行现场勘查等工作；
- 公司应尊重鉴定机构的独立性和专业性，不得干扰或影响鉴定结果的公正性。
承担相关费用（如适用）：
- 根据相关法律法规的规定，劳动能力鉴定的费用可能由公司承担，特别是当劳动者因工作原因受伤或患职业病时；
- 公司应按照鉴定机构的要求及时支付鉴定费用，确保鉴定工作的顺利进行。
接受并执行鉴定结果：
- 一旦劳动能力鉴定结果出具，公司应认真接受并执行鉴定结果；
- 如果公司对鉴定结果有异议，可以依法申请重新鉴定或采取其他法律途径解决争议，但在此过程中仍需遵守相关法律法规的规定，不得损害劳动者的合法权益。
额外建议：
- 公司应建立健全的劳动安全卫生制度和工伤保险制度，预防工伤事故和职业病的发生，减少劳动能力鉴定的需求；
- 在处理劳动能力鉴定相关事宜时，公司应保持与劳动者的良好沟通，确保信息的透明和公正；
- 如果公司在劳动能力鉴定过程中遇到法律难题或不确定如何操作，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律意见和帮助。