结论：船上打架被抓并判刑后，船公司是否支付船员工资需视具体情况而定，主要取决于劳动合同的约定、船员被判刑的性质以及船公司的规章制度。
分析说明：
劳动合同的约定：
- 劳动合同是船员与船公司之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定了船员在因违法行为被判刑的情况下，船公司有权不支付工资或解除劳动合同，那么船公司可能会依据这一条款来处理。
- 反之，如果劳动合同中没有相关约定，或者约定不明确，那么船公司不能单方面决定不支付工资。
船员被判刑的性质：
- 如果船员因打架等轻微违法行为被判刑，且该行为与船员的工作职责无直接关联，船公司可能会考虑继续支付部分或全部工资，尤其是如果船员在判刑前已经提供了劳动服务。
- 如果船员因严重违法行为（如故意伤害致人重伤或死亡）被判刑，且该行为严重违反了船公司的规章制度或职业道德，船公司可能会选择解除劳动合同并不支付工资。
船公司的规章制度：
- 船公司通常会有自己的规章制度，其中可能包括对员工违法行为的处理规定。如果规章制度中明确规定了员工因违法行为被判刑时，船公司有权不支付工资或解除劳动合同，那么船公司会依据这些规定来处理。
- 需要注意的是，船公司的规章制度必须合法合规，且已经向员工公示或告知，否则可能无法作为处理依据。
特殊场景：
- 如果船员在判刑期间仍然被船公司要求提供劳动服务（如通过远程方式完成部分工作），那么船公司应当支付相应的工资。
- 如果船员因判刑而无法继续提供劳动服务，且船公司因此遭受了经济损失，船公司可能会根据劳动合同或规章制度的规定，要求船员承担相应的赔偿责任。但这种赔偿责任与工资支付是两个不同的法律问题，需要分别处理。
行动建议：
- 对于船员：如果因打架等行为被判刑，并担心工资问题，建议首先查阅自己的劳动合同和船公司的规章制度，了解相关规定。同时，可以与船公司进行沟通协商，寻求合理的解决方案。
- 对于船公司：在处理此类问题时，应当遵循合法合规的原则，依据劳动合同和规章制度的规定来处理。如果需要解除劳动合同或不支付工资，应当确保有充分的法律依据和事实支持，并避免侵犯船员的合法权益。
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