结论：超时加班费用按奖金支付是违法的。
法律背景与解释：
加班费用的性质：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，加班费用是劳动者因超出正常工作时间工作而应获得的额外报酬，它是对劳动者额外劳动的补偿，具有明确的法定性和强制性。
- 奖金则是用人单位根据劳动者的工作表现、业绩或单位的经济效益等因素，给予劳动者的一种奖励性报酬，它并非劳动者因加班而必然获得的报酬。
加班费用的支付规定：
- 劳动者在法定工作时间以外工作的，用人单位应当按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%、200%、300%支付加班工资，具体标准根据加班时间（工作日、休息日、法定节假日）的不同而有所区别。
- 这些规定明确了加班费用的计算方式和支付标准，且加班费用必须单独列支，不得与奖金等其他报酬混淆。
将加班费用按奖金支付的违法性：
- 将加班费用按奖金支付，实际上是在规避法律对加班费用的明确规定，试图通过改变报酬的性质来减少用人单位的支付义务。
- 这种做法不仅损害了劳动者的合法权益，也违反了劳动法的相关规定，可能面临劳动行政部门的处罚，如责令支付加班费、加付赔偿金等。
法律建议：
劳动者角度：
- 如果发现用人单位将加班费用按奖金支付，劳动者有权要求用人单位按照法律规定支付加班费用。
- 劳动者可以向当地劳动行政部门投诉，或者通过劳动争议仲裁、诉讼等途径维护自己的合法权益。
用人单位角度：
- 用人单位应当严格遵守劳动法的相关规定，按照法定标准支付加班费用，不得将加班费用与奖金等其他报酬混淆。
- 用人单位可以通过合理调整工作时间、安排调休等方式来减少加班情况的发生，从而降低加班费用的支付压力。
可能的法律后果：
- 如果用人单位未按照法律规定支付加班费用，劳动行政部门可以责令其支付加班费，并可能加付赔偿金。
- 在极端情况下，如果用人单位的违法行为情节严重，还可能面临更严厉的行政处罚或刑事责任。
综上所述，超时加班费用按奖金支付是违法的，用人单位应当严格遵守劳动法的相关规定，确保劳动者的合法权益得到保障。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。