项目经理代付农民工工资这一行为本身并不直接构成违法，但具体是否合法需结合实际情况和相关法律规定来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 代付行为的合法性基础：

   • 在劳动关系中，工资支付通常应由用人单位直接支付给劳动者。然而，如果用人单位与项目经理之间存在明确的授权或委托关系，且该授权或委托不违反法律法规的强制性规定，那么项目经理代付工资的行为可以视为用人单位支付工资的一种合法方式。
   • 例如，如果项目经理是用人单位的法定代表人、负责人或经用人单位明确授权的代理人，且其代付行为符合用人单位的支付流程和规定，那么这种代付行为就是合法的。

2. 可能存在的法律风险：

   • 如果项目经理未经用人单位授权或委托，擅自代付农民工工资，这可能构成无权代理或表见代理，给用人单位带来法律风险。在这种情况下，如果农民工接受了项目经理的代付，并认为这是用人单位的支付行为，那么用人单位可能难以否认这一支付事实，从而面临工资已支付的举证责任。
   • 另外，如果项目经理代付工资时存在克扣、拖欠或挪用等违法行为，这不仅会损害农民工的合法权益，也会使用人单位承担连带责任或面临法律制裁。

3. 实际操作中的建议：

   • 为了避免法律风险，用人单位应明确工资支付的主体和流程，确保工资由用人单位直接支付给劳动者。如果确实需要项目经理代付工资，应签订明确的授权委托书，并规定代付的具体流程、金额和方式等。
   • 同时，用人单位应加强对项目经理的监督和管理，确保其代付行为合法合规，避免出现克扣、拖欠或挪用工资等违法行为。
   • 对于农民工来说，如果接受项目经理的代付工资，应要求项目经理出示用人单位的授权委托书或相关证明文件，并保留好支付凭证和记录，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。

总结来说，项目经理代付农民工工资是否违法取决于是否存在明确的授权或委托关系以及代付行为是否合法合规。为了避免法律风险和维护各方合法权益，建议用人单位明确工资支付主体和流程，并加强对项目经理的监督和管理。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。