土地出让金申请执行的主体通常为县级以上人民政府国土资源管理部门，具体分析如下：

1. 法律授权主体
   根据《中华人民共和国城市房地产管理法》第八条及《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第五条，县级以上地方人民政府土地管理部门（现职能整合至自然资源部门）依法负责土地出让金的征收管理。此类部门作为行政机关，在土地出让合同履行过程中若遇受让人拖欠出让金，可依据《行政强制法》第十二条申请法院强制执行。

2. 合同相对方主体
   若土地出让合同明确约定由特定政府职能部门（如开发区管委会）作为出让方签约，则该部门可作为申请执行主体。但需注意：

• 签约主体需具备独立法人资格；
  
• 合同条款需明确约定违约救济条款；
  
• 需通过行政协议诉讼或非诉执行程序主张权利。

1. 特殊情形下的主体变更
   在政府机构改革或职能调整中，若原国土资源部门被撤销或职能划转，根据《行政诉讼法》第二十六条第六款，继续行使其职权的行政机关为适格申请执行主体。实践中需通过政府公文、三定方案等证据证明职权承继关系。

实务建议：

1. 申请执行前应完成催告程序（《行政强制法》第五十四条），保留书面催告记录；
   
2. 需在法定申请期限内提出（自复议或诉讼期限届满之日起三个月内）；
   
3. 提交材料应包括：生效法律文书、执行申请书、出让合同、缴费通知、催告文书等；
   
4. 涉及集体建设用地出让的，需特别注意《土地管理法》第六十三条的特别规定。

如需进一步分析具体案件中的主体适格性问题，建议提供土地出让合同文本、政府职能调整文件等关键材料。