土地出让金滞纳金的收缴主体为县级以上人民政府自然资源主管部门。具体分析如下：

1. 法律依据
   根据《中华人民共和国城市房地产管理法》第十六条及《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第十四条，土地出让金由县级以上地方人民政府土地管理部门（现自然资源主管部门）负责征收。若受让人未按合同约定缴纳出让金，自然资源主管部门有权按日加收滞纳金，滞纳金标准通常为未缴金额的千分之一至千分之三（具体比例由地方性法规或出让合同约定）。

2. 收缴流程

   • 催缴阶段：自然资源主管部门通过书面通知、公告等方式催告受让人限期缴纳；
     
   • 滞纳金计算：逾期后按合同约定或地方规定标准计算滞纳金，与土地出让金本金一并追缴；
     
   • 强制执行：若受让人仍不履行，自然资源主管部门可申请法院强制执行，或依据《行政强制法》采取查封、扣押等措施。

3. 特殊情形

   • 协议出让与招拍挂出让：无论通过何种方式取得土地使用权，滞纳金收缴主体均为自然资源主管部门；
     
   • 地方性法规补充：部分省份（如《广东省土地使用权交易市场管理规定》）可能细化滞纳金比例或收缴程序，但不影响主管部门认定；
     
   • 历史遗留问题：若出让合同签订于自然资源部门成立前（如原国土资源局时期），仍由现自然资源主管部门继续行使职权。

提示：实践中需注意滞纳金与违约金的区别——滞纳金具有行政强制性，而违约金需通过合同约定。若对具体案例中的收缴主体或金额有疑问，可直接向我提供合同条款或地方政策，我将进一步分析。