结论：在实际损失大于违约金的情况下，您既可以选择申请提高违约金的额度，也可以在拿了违约金之后再就超出部分额外主张赔偿，但具体选择哪种方式需结合合同条款、法律规定及实际情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、申请提高违约金额度
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条：“约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。”
操作方式：
- 如果您认为合同中约定的违约金低于您实际遭受的损失，您可以向违约方提出增加违约金的请求。
- 如果违约方不同意，您可以向人民法院或仲裁机构提起诉讼或仲裁，请求增加违约金至与实际损失相当的水平。
注意事项：
- 您需要提供充分的证据证明您的实际损失大于约定的违约金，如损失清单、相关票据、鉴定报告等。
- 增加违约金的请求需在合理范围内，不能过分高于实际损失，否则可能不被支持。
二、拿了违约金之后再额外主张赔偿
法律依据：
- 同样根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，虽然该条款主要规定了违约金的调整，但并未禁止在违约金之外就超出部分主张赔偿。
- 如果违约金不足以弥补您的实际损失，您有权就超出部分要求违约方进行赔偿。
操作方式：
- 在收到违约金后，您可以与违约方协商就超出部分进行赔偿。
- 如果协商不成，您可以向人民法院提起诉讼，要求违约方赔偿超出违约金部分的实际损失。
注意事项：
- 您需要保留好相关证据，以证明您的实际损失确实超出了约定的违约金。
- 在诉讼过程中，您需要清晰阐述违约金与实际损失之间的差距，以及为何要求违约方进行额外赔偿。
三、综合建议
评估损失与违约金差距：
- 首先，您需要准确评估自己的实际损失与合同中约定的违约金之间的差距。
- 如果差距不大，且考虑到诉讼成本和时间成本，您可能更倾向于接受违约金并放弃额外主张。
- 如果差距较大，且您有足够的证据支持自己的主张，那么申请提高违约金额度或额外主张赔偿可能是更合适的选择。
考虑合同条款与法律规定：
- 仔细审查合同条款，看是否有关于违约金调整或额外赔偿的特别约定。
- 同时，了解相关法律规定，确保自己的主张有法律依据。
咨询专业律师：
- 在做出决定前，建议您咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和操作指导。
在实际操作中，您可以根据自己的具体情况和需求选择合适的方式。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。