关于公司员工在其他单位缴纳社保的合法性问题，这是一个涉及劳动法和社会保险法的重要议题。以下是对此问题的详细分析：

一、合法性分析

在大多数情况下，公司让其他公司代缴社保的行为是不合法的。根据《社会保险法》的明确规定，用人单位应当自成立及用工之日起规定时间内，向当地社会保险经办机构申请办理社会保险登记，并自行为员工缴纳社保。社保缴纳与劳动关系紧密相连，应当由建立劳动关系的用人单位为员工缴纳，以确保员工社保权益与实际工作情况相匹配。代缴社保使得社保缴纳主体与实际用人单位不一致，打破了这种对应关系，违反了社保制度的设计原则。

二、法律风险与后果

1. 对用人单位的风险：

   • 面临劳动部门的行政处罚，如被责令限期改正、罚款等。
   • 若因代缴社保导致劳动者在享受社保待遇时遇到障碍（如工伤认定复杂或无法认定），用人单位还可能承担额外的赔偿责任。

2. 对劳动者的风险：

   • 虽然表面上社保费用正常缴纳，但可能因社保关系与劳动关系不一致而在享受社保待遇时遭遇问题，如社保断缴、待遇降低等，影响自身权益。
   • 代缴公司可能存在不按时缴纳社保、漏缴、少缴等情况，进一步损害劳动者的社保权益。

三、特殊情况考量

在极少数特殊情况下，如集团公司内部的人力资源调配和管理，通过集团内具有独立法人资格的关联公司为员工代缴社保，并辅以合理的安排和说明，可能具有一定的合理性。但这种操作需要遵循严格的程序和规定，并向相关部门进行充分说明，以确保不损害员工的合法权益。然而，这种情况并不常见，且需要谨慎处理。

四、建议措施

1. 用人单位：

   • 应严格遵守《社会保险法》等相关法律法规，自行为员工办理社会保险登记和缴纳手续，确保劳动关系与社保关系的一致性。
   • 若存在代缴社保的情况，建议尽快进行纠正，以避免可能的法律后果。同时，应主动与员工沟通，解释相关情况，并采取必要措施保障员工的合法权益。

2. 劳动者：

   • 应了解自己的社保缴纳情况，若发现用人单位存在违法行为，有权向相关部门投诉或举报，以维护自己的合法权益和社会保险制度的正常运行。

综上所述，公司员工在其他单位缴纳社保的行为在大多数情况下是不合法的，存在较大的法律风险。用人单位应严格遵守相关法律法规，自行为员工缴纳社保，以确保员工的权益得到保障，并避免自身因违法行为而承担不必要的法律责任。