结论前置：聘任制书记员在提交辞职信后，不能直接不去上班，而应按照法律规定和单位要求完成离职手续，否则可能面临法律风险和不利后果。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律角度
辞职权的行使：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有辞职权，但应当提前通知用人单位。对于聘任制书记员而言，通常也需要遵循这一规定，提前向单位提交辞职申请，并按照单位的要求办理离职手续。
未履行离职手续的后果：
- 如果聘任制书记员在提交辞职信后直接不去上班，可能构成旷工，违反单位的规章制度。单位有权根据规章制度对旷工行为进行处罚，包括但不限于扣发工资、解除劳动合同等。
- 此外，如果因旷工给单位造成损失的，单位还有权要求赔偿。
二、实际操作角度
与单位沟通：
- 在提交辞职信后，应与单位进行积极沟通，了解离职手续的具体流程和要求。单位可能会要求填写离职申请表、交接工作、归还单位财物等。
- 通过沟通，可以确保离职过程的顺利进行，避免不必要的纠纷和误解。
完成离职手续：
- 按照单位的要求，完成所有离职手续。这包括但不限于提交离职申请、交接工作、办理社保转移等。
- 完成离职手续后，单位会出具离职证明，这是后续求职或办理其他事务的重要依据。
三、风险防范角度
保留证据：
- 在提交辞职信和办理离职手续的过程中，应保留好相关证据，如辞职信、离职申请表、交接清单等。这些证据在后续可能发生的纠纷中具有重要的证明作用。
避免口头约定：
- 在离职过程中，应尽量避免与单位进行口头约定。所有事项都应通过书面形式进行确认，以确保双方权益得到保障。
四、特殊情况处理
- 如果聘任制书记员因特殊原因（如突发疾病、家庭变故等）无法继续上班，应及时与单位沟通，说明情况，并按照单位的要求办理请假或离职手续。在这种情况下，单位通常会给予一定的理解和支持。
总结与建议：聘任制书记员在提交辞职信后，应按照法律规定和单位要求完成离职手续，不能直接不去上班。通过积极沟通、完成离职手续、保留证据和避免口头约定等方式，可以确保离职过程的顺利进行，并降低法律风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。