核心结论：员工面对公司在离职证明里扣押1000元工资并要求签字的情况，不能随意在离职证明上签字同意公司解聘，而应采取合理措施维护自身权益。以下从不同角度为你详细分析：

从离职证明的性质和作用角度

离职证明是用人单位与劳动者解除劳动关系的书面证明，其作用主要是证明劳动者与原用人单位的劳动关系已经解除或终止，为劳动者到新单位入职提供便利。离职证明应当客观、真实地反映劳动者与用人单位之间的劳动关系情况，包括入职时间、离职时间、工作岗位等信息，而不应包含与劳动关系解除无关的扣押工资等违法内容。

如果员工在离职证明上签字同意公司解聘，可能会被视为对离职证明上所有内容的认可，包括扣押工资这一违法行为。这可能会给员工后续主张被扣押的工资带来困难，因为公司可能会以员工已经签字确认为由进行抗辩。

从公司扣押工资的违法性角度

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。公司扣押员工1000元工资的行为明显违反了这一法律规定，属于违法行为。

员工有权要求公司立即支付被扣押的工资。如果公司拒绝支付，员工可以通过以下途径维护自己的合法权益：

1. 与公司协商：员工可以与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，说明公司扣押工资的行为是违法的，要求公司立即支付被扣押的工资。在协商过程中，员工可以保留好相关的沟通记录，如聊天记录、邮件等，以备后续维权使用。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对公司的违法行为进行调查和处理，并责令公司支付被扣押的工资。员工在投诉时，需要提供相关的证据，如劳动合同、工资条、离职证明等，以证明公司存在扣押工资的行为。
3. 申请劳动仲裁：员工还可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效途径，仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律规定，作出公正的裁决。如果员工对仲裁裁决不服，还可以向人民法院提起诉讼。

从员工签字同意解聘的法律后果角度

如果员工在离职证明上签字同意公司解聘，这可能会被视为员工主动与公司解除劳动关系。在这种情况下，员工可能无法享受一些与被动离职相关的权益，如经济补偿金等。

根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位在特定情况下解除劳动合同需要向劳动者支付经济补偿金。如果员工是因为公司的违法行为（如扣押工资）而被迫离职，员工有权要求公司支付经济补偿金。但如果员工在离职证明上签字同意解聘，可能会被认定为自愿离职，从而失去获得经济补偿金的机会。

建议：员工在面对公司在离职证明里扣押工资并要求签字的情况时，应坚决拒绝签字，并及时采取上述措施维护自己的合法权益。如果对相关法律问题存在疑问，可以直接向我咨询。