针对您提出的问题，即公司员工离职后，其驾驶过的公司车辆存在违章但尚未缴费的情况，我们可以按照以下步骤来处理：
一、查询违章信息
首先，公司车辆的管理人需要登录“交通安全综合服务管理平台”进行注册（如果尚未注册的话），并确保注册手机号的长期使用，以便接收相关通知。登录后，可以查询公司名下已备案车辆的违法信息，包括违章时间、地点、违章内容以及罚款金额等。
二、确定违章处理方式
接下来，根据车辆的性质（营运或非营运）以及违章的具体情况，选择合适的处理方式：
非营运车辆：
- 如果违章属于非现场交通违法，且罚款金额在200元以下（以福州为例，具体金额可能因地区而异），可以通过当地交警的官方微信平台（如“福州交警微发布”）进行预约处理。但需注意，这种方式可能只适用于特定类型的车辆，如非营运大中型载客汽车、非营运重中型载货汽车等以外的福州籍车辆。
- 对于其他类型的非营运车辆违章，或者罚款金额超过规定限额的，可能需要前往交警大队法制室或指定的自助服务中心进行现场处理。
营运车辆：
- 对于公司名下注册登记的营运车辆，违章处理通常更为严格。车辆管理人需要登录“交通安全综合服务管理平台”查询违章信息，并由违法当事人（即原驾驶员工或公司指定的其他人员）携带车辆行驶证、身份证及驾驶证前往城区各交警大队法制室或指定的自助服务中心进行现场处理。
三、完成罚款缴纳
在违章处理完成后，需要按照处理结果完成罚款的缴纳。缴纳方式可能包括：
- 现场缴纳：在交警大队法制室或自助服务中心直接缴纳罚款。
- 线上缴纳：通过“交管12123”APP、当地交警的官方微信平台或其他指定的线上支付平台完成罚款缴纳。这种方式更为便捷，可以节省时间和精力。
四、特殊情况处理
- 如果原驾驶员已经离职且无法联系，公司可以指定其他人员作为违法当事人进行处理。但需注意，处理时需要提供相关证件和资料，以证明其有权代表公司处理违章事宜。
- 如果违章处理过程中遇到任何问题或困难，可以及时向当地交警部门咨询或寻求帮助。
五、预防措施
为了避免类似情况再次发生，公司可以采取以下预防措施：
- 加强对公司车辆的管理和监督，确保车辆使用符合规定和流程。
- 定期对公司车辆进行违章查询和处理，及时发现并解决问题。
- 对驾驶员进行交通安全教育和培训，提高其交通安全意识和法律意识。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时联系我们。