结论：在起诉离婚且被告不同意抚养两个小孩的情况下，法院会根据双方的具体情况，包括经济能力、生活环境、与孩子的感情联系等因素，来判决孩子的抚养权归属。以下是对此问题的详细分析：

1. 法院判决抚养权的原则：

   • 法院在判决抚养权时，首要考虑的是孩子的最佳利益。这包括孩子的身心健康、教育、生活环境等多方面因素。
   • 法院会评估双方的经济能力、居住条件、教育背景等，以确定哪一方更适合抚养孩子。
   • 如果孩子已满一定年龄（通常是8周岁），法院还会考虑孩子的意愿。

2. 被告不同意抚养的影响：

   • 被告不同意抚养两个小孩，并不意味着被告就完全失去了抚养权。法院会综合考虑双方的情况，包括被告的抚养意愿和能力，来做出判决。
   • 如果被告确实没有抚养能力或条件，而原告具备更好的抚养条件，法院可能会将抚养权判给原告。
   • 如果双方条件相当，或者被告虽然不同意但仍有抚养能力，法院可能会考虑判决双方共同抚养，或者根据具体情况将抚养权判给其中一方，并要求另一方支付抚养费。

3. 可能的法律后果：

   • 如果法院判决一方获得抚养权，另一方通常需要支付抚养费，以支持孩子的成长和生活。
   • 抚养费的数额会根据双方的收入、孩子的需求以及当地的生活水平等因素来确定。
   • 如果一方不履行抚养义务，另一方可以向法院申请强制执行。

4. 建议：

   • 在起诉离婚前，建议双方先尝试通过协商来解决抚养权问题。协商过程中，可以充分考虑孩子的利益和双方的实际情况，寻求一个双方都能接受的解决方案。
   • 如果协商无果，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径来解决抚养权问题。律师可以提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助当事人维护自己的合法权益。
   • 在诉讼过程中，要积极配合法院的调查和调解工作，提供必要的证据和材料，以支持自己的主张。

举例说明：假设在离婚诉讼中，原告和被告都希望获得两个孩子的抚养权，但被告经济能力较弱且居住条件不佳。在这种情况下，法院可能会考虑将抚养权判给原告，并要求被告支付一定的抚养费。如果被告拒绝支付抚养费，原告可以向法院申请强制执行。

进一步思考：抚养权问题不仅涉及法律层面，还涉及情感、道德和社会责任等多个方面。因此，在处理抚养权问题时，除了考虑法律因素外，还应充分考虑孩子的利益和感受，以及双方的实际能力和条件。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。