在起诉离婚且涉及两个小孩抚养权，而男方不同意的情况下，你可以按照以下步骤和思路来处理：

1. 明确诉讼请求与准备证据：

   • 在提起离婚诉讼时，你需要在民事起诉状中明确你的诉讼请求，包括请求法院判决离婚以及两个小孩的抚养权归属。
   • 准备充分的证据来支持你的诉讼请求，如结婚证、婚姻基础状况的证明材料、婚后夫妻感情变化的证明材料，以及关于小孩抚养能力的证明（如经济状况、居住条件、教育背景等）。这些证据将有助于法院了解你的实际情况和抚养小孩的优势。

2. 遵循法院程序与参与调解：

   • 向人民法院提起诉讼申请后，经立案大厅审查符合立案条件的，将准予立案。立案后，法院会发出立案通知书，你需要凭立案通知书缴纳诉讼费，之后法院将正式受理案件。
   • 民事庭受案后，会向男方发出传票，要求其到庭应诉。同时，法院也会通知你到庭参诉。双方到庭后，法院会进行调解，这是离婚诉讼的必经程序。在调解过程中，你可以充分表达你的意愿和理由，争取法院的理解和支持。

3. 开庭审理与抚养权判决：

   • 如果调解无效，法院将通过开庭审理案件。在审理过程中，法院会根据你和男方提供的证据以及双方的陈述，综合考虑小孩的年龄、性别、健康状况、成长环境、双方的抚养能力和抚养条件等因素，作出是否准予离婚以及小孩抚养权归属的判决。
   • 关于抚养权的判决原则：法院在判决抚养权时，会遵循最有利于未成年子女的原则。如果小孩年龄较小（如两周岁以下），法院可能会倾向于判决给母亲抚养，但这并不是绝对的，还需要考虑其他因素。如果小孩年龄较大（如八周岁以上），法院可能会尊重小孩的意愿，询问小孩愿意跟随哪一方生活。

4. 应对男方不同意的策略：

   • 男方不同意离婚和抚养权归属是常见的诉讼现象。你需要保持冷静和理性，通过法律途径来维护自己的权益。
   • 在诉讼过程中，你可以积极与法院沟通，说明你的抚养优势和男方的不足，争取法院的支持。同时，你也可以尝试与男方进行协商，看是否能够达成一致意见，从而避免漫长的诉讼过程。

5. 后续行动与注意事项：

   • 如果法院判决你获得抚养权，你需要按照判决履行抚养义务，为小孩提供良好的成长环境。
   • 如果法院判决男方获得抚养权或双方共同抚养，你需要尊重判决结果，并积极配合男方或双方共同履行抚养义务。
   • 在任何情况下，你都应该保持与男方的良好沟通，共同关注小孩的成长和发展，避免因为离婚而给小孩带来不必要的伤害。

最后，需要强调的是，离婚诉讼和抚养权判决是一个复杂而敏感的过程。如果你在这个过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。