公司因效益不好进行停工休整是否合法，需分情况讨论：
若公司停工休整符合法律法规及劳动合同约定：
- 合法性依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在特定情况下，如生产经营发生严重困难等，可以与劳动者协商一致后，采取调整工作岗位、降低工资、缩短工作时间等措施，包括停工休整。但关键在于，这种调整或停工必须基于与劳动者的协商一致，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 具体操作：公司应提前与员工进行充分沟通，说明停工休整的原因、期限、工资支付等关键事项，并尽量达成书面协议。若员工同意，则停工休整合法；若员工不同意，公司则不能单方面强制实施。
若公司停工休整违反法律法规或劳动合同约定：
- 违法性表现：如果公司未经与员工协商一致，单方面决定停工休整，且未按照法律法规或劳动合同约定支付员工工资或生活费，则可能构成违法。例如，公司停工期间未支付员工基本生活费，或者停工期限过长且未提供合理的解释和补偿方案。
- 法律后果：员工有权向劳动监察部门投诉，要求公司纠正违法行为，并可能要求公司支付拖欠的工资、经济补偿金等。在极端情况下，员工还可以选择解除劳动合同，并要求公司支付赔偿金。
额外建议与注意事项：
- 沟通协商：公司在进行停工休整前，应尽可能与员工进行充分沟通，解释停工的原因、期限和工资支付等关键事项，以争取员工的理解和支持。
- 书面协议：为避免后续纠纷，公司应与员工就停工休整事宜达成书面协议，明确双方的权利和义务。
- 遵守法律法规：公司在停工休整期间，应严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益不受侵害。例如，按照法律法规或劳动合同约定支付员工工资或生活费。
- 关注员工情绪：停工休整可能对员工的情绪和生活产生一定影响，公司应关注员工的情绪变化，提供必要的心理支持和帮助。
总结来说，公司因效益不好进行停工休整是否合法，取决于是否符合法律法规及劳动合同约定，以及是否与员工进行了充分沟通并达成一致。若公司能够遵守相关法律法规，与员工进行充分沟通并达成书面协议，则停工休整是合法的；否则，可能构成违法并面临相应的法律后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。