结论：占用工作时间开会，不参加是否算请假合法，这主要取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定。若公司规章制度或劳动合同中明确规定了此类会议必须参加，且未参加需按请假处理，则公司的做法可能是合法的；反之，若没有相关规定或约定，则公司的做法可能不合法。
分析：
公司规章制度与劳动合同的约定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位有权制定合理的规章制度来管理员工，但这些规章制度必须合法、合理，且不得与劳动合同相抵触。
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了员工必须参加公司组织的会议，且未参加将视为请假或旷工，并可能受到相应的纪律处分，那么员工不参加会议，公司按请假处理是合法的。
会议的性质与必要性：
- 如果会议是公司正常运营所必需的，且涉及员工的工作职责或利益，那么员工有义务参加。
- 如果会议并非必要，或者与员工的工作职责无直接关联，那么员工不参加会议可能不应被视为请假。
公司的处理方式与程序：
- 即使公司规章制度或劳动合同中有相关规定，公司在处理员工不参加会议的情况时，也应遵循公平、公正、合理的原则，并确保处理程序合法。
- 公司应提前通知员工会议的时间、地点和内容，以便员工做好准备。如果员工因故无法参加，应允许员工提前请假或说明情况。
建议：
员工角度：
- 在入职时，应仔细阅读公司的规章制度和劳动合同，了解其中关于会议参加和请假的相关规定。
- 如果对公司的规定有疑问或不满，应及时与公司沟通或咨询专业律师。
- 如果因故无法参加会议，应提前向公司请假或说明情况，以避免不必要的纠纷。
公司角度：
- 在制定规章制度和劳动合同时，应明确规定员工参加会议的义务和请假程序。
- 在处理员工不参加会议的情况时，应遵循公平、公正、合理的原则，并确保处理程序合法。
- 应加强与员工的沟通，了解员工的需求和困难，以便更好地管理员工和安排会议。
可能后果：
- 如果公司规章制度或劳动合同中有明确规定，且员工未遵守，公司可能按照规定对员工进行纪律处分，如扣减工资、警告、解雇等。
- 如果公司规章制度或劳动合同中没有相关规定，或规定不明确，公司单方面将员工不参加会议视为请假可能引发劳动争议，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。
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