结论：国企员工干自己单位的工程是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论。
如果员工具备相应资质且符合单位规定：
- 在许多情况下，国企员工如果具备从事相关工程的专业资质（如建筑师、工程师等执业资格），并且单位内部有明确的规定允许员工参与本单位工程，那么这种行为是合法的。例如，单位可能鼓励员工利用业余时间参与单位的小型维修或改造项目，只要这些活动不违反单位的规章制度，也不影响员工的本职工作，就是被允许的。
如果员工不具备资质或违反单位规定：
- 如果员工不具备从事相关工程的专业资质，或者单位有明确规定禁止员工参与本单位工程，而员工仍然擅自参与，那么这种行为可能是违法的。这可能涉及到无证施工、违反单位规章制度等问题，不仅可能对员工个人造成法律责任，还可能对单位造成损失和不良影响。
如果涉及利益冲突或腐败行为：
- 更为严重的情况是，如果员工在参与本单位工程的过程中存在利益冲突或腐败行为，如利用职务之便谋取私利、收受贿赂等，那么这种行为肯定是违法的，并且可能构成犯罪。这种情况下，员工不仅可能面临法律制裁，还可能受到单位的纪律处分。
法律背景与建议：
- 从法律角度来看，国企员工参与本单位工程是否违法，主要取决于员工是否具备相应资质、是否符合单位规定以及是否存在利益冲突或腐败行为。
- 对于员工而言，在参与本单位工程前，应仔细了解单位的相关规定和要求，确保自己具备从事相关工程的专业资质，并避免存在任何利益冲突或腐败行为。
- 如果员工对单位的规定或要求存在疑问，或者不确定自己的行为是否合法，应及时向单位的相关部门或法律顾问咨询，以避免不必要的法律风险。
可能后果：
- 如果员工的行为被认定为违法或违规，可能面临单位的纪律处分，如警告、罚款、降职甚至开除等。
- 在严重的情况下，如果员工的行为构成犯罪，还可能面临刑事制裁，如有期徒刑、罚金等。
因此，国企员工在参与本单位工程时，应谨慎行事，确保自己的行为合法合规。如果有任何疑问或不确定之处，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。