结论：国企员工负责工程业务，然后与自己开的公司合作获利，这一行为是否违法，需根据具体情况判断，但通常存在较高的违法风险，可能涉及违反竞业禁止义务、利益冲突、贪污受贿等法律问题。
详细分析：
竞业禁止义务：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，国企员工，特别是担任一定管理职务的员工，通常负有竞业禁止义务。这意味着他们不得未经允许，利用职务便利为自己或他人谋取属于公司的商业机会，或自营与所任职公司同类的业务。
- 如果该员工负责的工程业务与其自己开的公司存在业务竞争或利益关联，且未经国企的同意或批准，那么这种合作获利行为很可能违反了竞业禁止义务。
利益冲突：
- 国企员工在处理工程业务时，应始终以国企的利益为重。如果他们同时与自己开的公司合作，可能会产生利益冲突，即个人利益与国企利益之间的冲突。
- 这种利益冲突可能导致员工在决策时偏向于自己开的公司，从而损害国企的利益。这种行为不仅可能违反职业道德，还可能构成违法。
贪污受贿风险：
- 如果国企员工利用自己的职务便利，通过与自己开的公司合作来获取不正当利益，如虚报工程费用、收受回扣等，那么这种行为可能构成贪污或受贿。
- 贪污和受贿是严重的违法行为，不仅会导致个人面临刑事处罚，还会严重损害国企的声誉和利益。
法律建议：
- 避免利益冲突：国企员工应严格避免与自己开的公司进行可能产生利益冲突的合作。如果确实需要合作，应事先获得国企的明确同意，并确保合作条款公平、透明，不损害国企的利益。
- 遵守竞业禁止义务：员工应仔细阅读并遵守国企的规章制度以及相关法律法规中关于竞业禁止的规定。如果对自己的行为是否违反竞业禁止义务存在疑问，应及时咨询法律专业人士。
- 保持职业操守：国企员工应始终保持高度的职业操守和道德标准，不利用职务便利谋取私利，不损害国企的利益和声誉。
可能后果：
- 如果国企员工与自己开的公司合作获利的行为被认定为违法，他们可能面临刑事处罚、民事赔偿以及行政处罚等严重后果。
- 同时，这种行为也会严重损害员工的个人声誉和职业发展前景，甚至可能导致其被国企开除或行业禁入。
因此，我建议国企员工在处理工程业务时，务必谨慎行事，避免与自己开的公司进行可能产生利益冲突的合作。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。