结论：保险公司不理赔是否合法，需分情况讨论，主要取决于事故是否符合工伤保险的认定条件以及保险合同的具体约定。以下为详细分析：
工伤保险的认定与交通事故责任划分
- 根据《工伤保险条例》第十四条第六项的规定，员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。这意味着，如果员工在交通事故中负主要责任，那么该事故通常不会被认定为工伤。
- 既然事故未被认定为工伤，那么员工就无法享受工伤保险的相关待遇，包括由工伤保险基金支付的医疗费用、伤残津贴等。在这种情况下，保险公司（如果是指工伤保险的承保机构）不理赔是合法的，因为不符合工伤保险的支付条件。
商业保险的理赔情况
- 如果员工购买了商业保险，如意外伤害保险等，那么理赔情况将取决于保险合同的具体约定。
- 商业保险合同通常会明确列出保险责任、免责条款等内容。如果合同中明确规定，在员工负主要责任的交通事故中，保险公司不承担赔偿责任，那么保险公司不理赔就是合法的。
- 如果合同中没有这样的规定，或者规定不明确，那么保险公司可能需要根据合同的其他条款以及相关法律法规来判断是否应该理赔。在这种情况下，员工有权要求保险公司进行理赔，如果保险公司拒绝理赔，员工可以通过法律途径来维护自己的权益。
建议与行动
- 对于员工来说，如果发生了上班路上的交通事故，并且自己负主要责任，首先应该了解自己的保险情况，包括是否购买了工伤保险和商业保险，以及保险合同的具体内容。
- 如果认为保险公司不理赔的决定不合理或违法，可以收集相关证据，如交通事故认定书、保险合同、医疗费用单据等，然后向保险公司提出申诉或投诉。
- 如果申诉或投诉无果，可以考虑通过法律途径来解决争议，比如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
如有更多细节或疑问，欢迎直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。