结论：上二休一的工作安排本身并不直接违法，但能否覆盖年假需根据具体情况判断，关键在于该安排是否保障了员工享受年假的合法权益。以下从不同角度详细分析：

一、上二休一工作安排本身的合法性

上二休一，即工作两天休息一天，是一种常见的工作安排方式。从劳动法的角度来看，这种安排本身并不违法，只要它符合以下条件：

1. 符合法定工作时间：根据《劳动法》的规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果上二休一的工作安排能够确保员工每周的工作时间不超过这一标准，那么它就是合法的。

2. 保障员工休息权：员工有权享受休息和休假，这是劳动法赋予的基本权利。上二休一的工作安排如果能够确保员工有足够的休息时间，不损害其身心健康，那么也是合法的。

二、上二休一能否覆盖年假

年假是劳动者依法享受的带薪休假，其天数根据劳动者的工作年限确定。上二休一的工作安排能否覆盖年假，需考虑以下因素：

1. 年假的独立性：年假是劳动者依法享有的独立权利，不受工作安排方式的影响。即使实行上二休一的工作制度，员工仍然有权享受年假。

2. 工作安排与年假的协调：如果用人单位希望将上二休一的工作安排与年假相结合，需要确保这种安排不会损害员工的年假权益。例如，可以通过调整工作安排，确保员工在年假期间能够完全休息，不受工作干扰。

3. 双方协商与同意：根据《劳动法》的规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同的内容。如果用人单位希望将上二休一的工作安排作为年假的一种形式，需要与员工进行协商，并取得员工的同意。

三、可能存在的法律风险与建议

1. 法律风险：如果用人单位未经员工同意，擅自将上二休一的工作安排作为年假，可能构成对员工年假权益的侵害，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

2. 建议：

   • 明确约定：用人单位在与员工签订劳动合同时，应明确约定年假的享受方式、天数以及工作安排与年假的协调方式。
   • 协商一致：如果用人单位希望变更年假的享受方式，应与员工进行充分协商，并取得员工的同意。
   • 保障权益：无论采用何种工作安排方式，用人单位都应确保员工的合法权益不受侵害，包括年假权益、休息权等。

举例说明：假设某员工实行上二休一的工作制度，每周工作6天（每天8小时），休息1天。如果该员工的工作年限符合享受年假的条件，那么用人单位不能仅因其实行上二休一的工作制度就剥夺其年假权益。用人单位应与员工协商，确定年假的具体享受方式，如安排在休息日之后连续休假等。

总结：上二休一的工作安排本身并不违法，但能否覆盖年假需根据具体情况判断。用人单位应确保员工享受年假的合法权益不受侵害，并与员工进行充分协商。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。