针对您提出的“协议薪资结构变更，总额变少怎么办理”的问题，这确实是一个涉及劳动合同变更和劳动者权益的重要事项。以下是我为您提供的详细解答：
一、理解薪资结构变更的法律背景
首先，需要明确的是，薪资结构是劳动合同中的重要组成部分。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括薪资结构。但变更应当采用书面形式，并确保变更后的内容不违反法律、行政法规且不违背公序良俗。
二、分析薪资总额变少的可能情况
公司单方面调整：
- 如果公司未经您同意，单方面调整薪资结构导致总额变少，这可能构成违法变更劳动合同。
- 在这种情况下，您有权拒绝接受新的薪资结构，并可以要求公司按照原合同履行。
双方协商一致调整：
- 如果公司提出调整薪资结构，并与您进行了充分协商，且您同意了新的薪资结构，那么这种调整是合法的。
- 但即便如此，如果调整后的薪资总额明显低于市场水平或您的预期，您仍然有权在协商过程中表达不满，并尝试争取更合理的薪资。
三、应对薪资总额变少的建议步骤
与公司沟通：
- 首先，建议您与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解薪资结构变更的具体原因和背景。
- 表达您对薪资总额变少的关切和不满，并询问公司是否有其他补偿措施或调整方案。
审查劳动合同：
- 仔细审查您的劳动合同，特别是关于薪资结构的条款，确认公司是否违反了合同约定。
- 如果合同中有关于薪资结构变更的明确规定，如需要双方协商一致并书面确认等，您可以据此与公司进行交涉。
收集证据：
- 收集与薪资结构变更相关的所有证据，包括公司发布的通知、邮件、聊天记录等。
- 这些证据将有助于您在后续的协商或法律程序中维护自己的权益。
寻求法律援助：
- 如果与公司沟通无果，且您认为公司的行为侵犯了您的合法权益，您可以考虑寻求法律援助。
- 咨询专业律师，了解您的法律权益和可能的维权途径，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
考虑离职或协商补偿：
- 如果薪资总额变少对您的生活造成了较大影响，且您无法接受新的薪资结构，您可以考虑离职并寻找新的工作机会。
- 在离职前，您可以与公司协商是否给予一定的经济补偿或离职补偿金。
四、注意事项
- 在整个过程中，保持冷静和理性，避免与公司发生不必要的冲突。
- 确保所有沟通都留有书面记录，以便在需要时作为证据使用。
- 如果您决定寻求法律援助或申请劳动仲裁，请确保在法定时限内提出申请。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。