核心结论：公司员工感染乙肝后的赔偿问题需分情况讨论，主要取决于感染原因、公司是否存在过错以及是否构成工伤等因素。以下是具体分析：

1. 若感染乙肝与工作无关，且公司无过错
   乙肝主要通过血液、母婴和性接触传播，日常接触（如共餐、握手）不会传染。若员工感染乙肝系个人原因（如自身生活习惯、家庭感染等），且公司已尽到劳动安全卫生义务（如提供安全的工作环境、定期组织体检等），则公司无需承担赔偿责任。员工可依据医保或商业保险自行承担医疗费用。

2. 若感染乙肝与工作有关，且公司存在过错
   若员工因工作原因（如接触乙肝病毒污染的医疗器具、实验室环境等）感染乙肝，且公司未提供必要的防护措施（如未配备防护装备、未进行职业健康检查等），则公司可能构成侵权或违反《职业病防治法》。此时员工可要求公司承担：

   • 医疗费用：包括治疗、药品、住院等费用；
     
   • 误工费：因治疗导致的收入损失；
     
   • 残疾赔偿金：若感染导致残疾，按伤残等级赔偿；
     
   • 精神损害抚慰金：若感染对员工心理造成严重伤害。
     员工需提供证据证明感染与工作直接相关（如职业病诊断证明、工作记录等），并通过劳动仲裁或诉讼主张权利。

3. 若感染乙肝被认定为工伤
   根据《工伤保险条例》，若员工感染乙肝属于“在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到事故伤害”或“患职业病”的情形，可申请工伤认定。认定后，员工可享受工伤保险待遇，包括：

   • 工伤医疗费用：由工伤保险基金支付；
     
   • 伤残津贴：若构成伤残，按月领取；
     
   • 一次性工伤医疗补助金：离职时领取。
     若公司未缴纳工伤保险，则全部待遇由公司承担。

建议行动：

• 员工应尽快就医并保留医疗记录，同时向公司报告感染情况；
  
• 若怀疑与工作相关，可要求公司协助申请职业病诊断或工伤认定；
  
• 若公司拒绝承担责任，可向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律程序和证据要求。