当公司违法解除劳动合同时，员工在仲裁期间的工资计算是一个核心问题，它直接关系到劳动者的合法权益保护。以下是对此问题的详细解答：
一、工资计算原则
正常工资支付原则：
- 在公司违法解除劳动合同之前，员工应获得其正常工作期间的全部工资，这包括基本工资、奖金、津贴等所有应得收入。
- 工资的计算应严格按照劳动合同的约定或公司的薪酬制度进行。
违法解除期间的工资支付：
- 若公司违法解除劳动合同，且员工要求继续履行劳动合同，公司应支付员工在仲裁期间按照原工资福利待遇标准的工资。
- 若员工选择主张经济赔偿金，且在此期间未实际提供劳动，通常公司无需支付仲裁期间的工资。但员工若能证明是因公司原因导致其无法正常工作（如公司恶意停职、不让员工进入办公场所等），公司可能需支付一定的生活费或合理费用，具体标准参照当地最低工资标准的一定比例。
二、具体计算方法
确定工资基数：
- 通常以员工在劳动合同解除前十二个月的平均工资作为计算基数。
- 如果员工工作时间不足十二个月，则按实际工作的月数计算平均工资。
计算应发工资：
- 根据员工在违法解除期间本应获得的工资天数（如按月计算则为整月工资），乘以工资基数，得出应发工资总额。
考虑特殊情况：
- 如果员工在违法解除期间有加班、休假等特殊情况，还需根据劳动法的相关规定对工资进行相应调整。
三、法律依据与赔偿
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十八条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应当继续履行；劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当支付赔偿金。
赔偿金计算：
- 赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍。
- 经济补偿按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
四、实际操作建议
保留证据：
- 员工应妥善保管与公司签订的劳动合同、工资条、考勤记录等所有与工作相关的证据，以便在维权时提供有力支持。
及时沟通：
- 发现公司存在违法解除合同的行为后，员工应及时与公司沟通，要求公司纠正错误并支付应得工资。
申请仲裁或诉讼：
- 如果公司拒绝支付或双方无法达成一致意见，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，甚至提起诉讼来维护自己的合法权益。
综上所述，当公司违法解除劳动合同时，员工在仲裁期间的工资计算应严格遵循相关法律法规，并根据具体情况进行合理调整。员工应积极采取措施保护自己的合法权益，必要时可寻求法律途径进行维权。