生病住院期间履职困难，给予员工警告处分一般是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，员工在生病住院期间，享有法定的医疗期。在医疗期内，员工因身体原因无法正常履行工作职责，这是受到法律保护的特殊情况。用人单位应当给予员工必要的理解和支持，而不是进行处罚。如果用人单位在员工医疗期内给予警告处分，可能构成对员工合法权益的侵犯，员工有权依法维护自己的权益。

实际情况角度

1. 医疗期的确定：医疗期的长短根据员工的工作年限和在本单位的工作年限来确定，一般为3个月到24个月不等。在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费，且用人单位不得解除劳动合同。
2. 履职困难的原因：员工生病住院导致履职困难，这是非主观因素造成的。员工本身并无过错，因此用人单位不应因此给予处罚。
3. 警告处分的合理性：警告处分通常用于员工违反公司规章制度或工作纪律的情况。在员工生病住院期间，由于身体原因无法履职，并不构成违反规章制度或工作纪律的行为，因此给予警告处分显然不合理。

应对建议

1. 与用人单位沟通：如果员工在生病住院期间被给予警告处分，首先应与用人单位进行沟通，说明自己的情况，并要求撤销不合理的处分。
2. 寻求法律援助：如果沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
3. 保留证据：在处理此类问题时，员工应保留好相关证据，如医疗证明、病假条、警告处分通知等，以便在需要时提供证明。

可能的法律后果

如果用人单位在员工医疗期内给予警告处分，并因此导致员工权益受损，员工有权要求用人单位承担相应的法律责任。这可能包括撤销处分、恢复名誉、赔偿损失等。在极端情况下，如果用人单位的行为构成违法解除劳动合同，员工还有权要求用人单位支付经济补偿金或赔偿金。

综上所述，生病住院期间履职困难给予员工警告处分是不合法的。员工应了解自己的权益，并在必要时采取法律措施维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。