结论：公司放假1年多未发工资，但个人所得税有申报，这一行为通常是不合法的。以下从多个角度进行分析：
一、工资支付义务
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。即使劳动者处于放假状态，只要劳动关系存续，用人单位就应当支付基本生活费或按照约定支付工资。公司放假1年多未发工资，显然违反了这一规定。
二、个人所得税申报与工资支付的关系
个人所得税的申报是基于实际发生的工资薪金所得进行的。如果公司未实际支付工资，却进行了个人所得税的申报，这可能存在以下问题：
- 虚假申报：公司可能为了某种目的（如避税、维持公司财务状况等）而进行了虚假申报，这是不合法的。
- 误导税务机关：虚假申报可能误导税务机关对公司财务状况的判断，影响税收征管的公正性和有效性。
- 损害劳动者权益：对于劳动者而言，虚假申报可能导致其个人所得税记录与实际收入不符，影响其未来的税收信用和权益。
三、可能的法律后果
对于公司：
- 税务机关可能对公司进行税务稽查，要求补缴税款、滞纳金和罚款。
- 劳动者可能向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付拖欠的工资和赔偿金。
- 公司的行为可能构成违法，面临行政处罚甚至刑事责任（如逃税罪等，但需根据具体情节判断）。
对于劳动者：
- 劳动者有权要求公司支付拖欠的工资和赔偿金。
- 劳动者可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 如果因公司虚假申报导致个人所得税记录受损，劳动者可以向税务机关申请更正或提出异议。
四、建议与行动
- 收集证据：劳动者应收集与公司签订的劳动合同、工资条、放假通知等相关证据，以证明公司未支付工资的事实。
- 与公司协商：在收集到足够证据后，劳动者可以尝试与公司进行协商，要求公司支付拖欠的工资和赔偿金。
- 投诉与仲裁：如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，通过法律途径维护自己的权益。
- 税务咨询：对于个人所得税申报的问题，劳动者可以向当地税务机关咨询或提出异议，确保自己的税收记录准确无误。
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