在处理建工案件中合同无效的情况时，我们需要依据《民法典》及《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》等相关法律法规，来综合考量并给出恰当的处理方案。以下是对这一问题的详细解答：

一、合同无效的情形

首先，我们需要明确哪些情形会导致建设工程施工合同无效。这主要包括：

1. 承包人资质问题：承包人未取得建筑业企业资质或超越资质等级承包工程，这样的合同自始无效。
2. 借用资质：无资质的实际施工人借用有资质企业名义签订合同，这种挂靠行为同样导致合同无效。
3. 违法转包或分包：承包人将全部工程转包或分包单位再次分包，违反了相关法律法规，合同无效。
4. 违反法定建设程序：必须进行招标的工程未招标或中标无效，这样的合同也是无效的。
5. 未取得许可证：发包人未取得建设工程规划审批手续即签订合同，合同同样无效。

二、合同无效但工程验收合格的处理

若合同无效，但工程经竣工验收合格，那么承包人有权请求参照合同约定支付工程价款。这是基于折价补偿原则，即尽管合同无效，但承包人的劳动成果已经物化于工程中，应当得到相应的补偿。例如，甲建筑公司与乙开发商的施工合同无效，但工程验收合格，乙开发商仍需按合同约定支付工程款给甲建筑公司。

三、合同无效且工程验收不合格的处理

1. 修复后验收合格：若工程初次验收不合格，但经承包人修复后再次验收合格，承包人有权请求支付工程价款，但需承担修复费用。比如，某工程因质量问题初验不合格，承包人修复后通过验收，发包人应支付工程款，修复费用由承包人承担。
2. 无法修复或修复后仍不合格：若工程无法通过修复达到合格标准，承包人无权请求支付工程价款。此时，发包人可能还需根据合同条款或法律规定追究承包人的违约责任或赔偿责任。

四、过错方的损失赔偿责任

对于合同无效导致的损失，应由过错方对另一方承担相应的赔偿责任。赔偿金额应结合双方过错程度、因果关系等因素确定。例如，若发包人不合理压缩工期导致工程质量问题，发包人应承担相应损失赔偿责任。

五、非法所得的收缴与处理争议

1. 非法所得收缴：若承包人或发包人通过非法手段获取利益，如行贿、欺诈等，人民法院可依法收缴其非法所得。
2. 解决争议途径：在合同无效情况下，当事人可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决因工程价款、质量等问题产生的争议。

六、实际操作建议

1. 严格审查合同效力：在签订建设工程施工合同前，应仔细审查承包人的资质、招投标程序等，确保合同合法有效。
2. 加强工程质量监管：施工过程中应加强质量监控，确保工程质量符合验收标准，避免后续纠纷。
3. 妥善处理合同无效后果：一旦发生合同无效情况，应依法妥善处理工程价款结算、损失赔偿等问题，维护双方合法权益。

综上所述，处理建工案件中合同无效的情况需要综合考虑多种因素，并根据具体法律法规和合同条款进行决策和处理。在实际操作中，我们应注重预防与应对相结合，确保工程顺利进行并维护各方合法权益。