当建工案件中的挂靠合同被认定为无效后，当事人应采取一系列措施来妥善处理后续事宜，以维护自身合法权益并减少损失。以下是对此问题的详细解答：
一、立即停止合同履行
一旦挂靠合同被认定为无效，继续履行该合同将失去法律依据，并可能带来进一步的法律风险和经济损失。因此，当事人应立即停止合同的履行，避免损失进一步扩大。
二、工程价款结算与损失赔偿
工程价款结算：
- 若建设工程经验收合格，尽管合同无效，但根据相关法律法规，承包人（实际施工人）仍有权要求参照合同关于工程价款的约定进行折价补偿。
- 若工程初验不合格但经修复后验收合格，承包人应承担修复费用，之后可参照合同约定请求支付工程价款。
- 若修复后工程仍不合格，承包人则无权请求折价补偿。同时，若发包人对工程不合格有过错，也应承担相应责任。
损失赔偿：
- 合同无效后，双方应根据各自的过错程度承担相应的损失赔偿责任。赔偿范围可能涵盖直接损失（如材料费、工人工资）和间接损失（如预期利益）。
- 法院在确定具体赔偿数额时，会综合考虑双方过错、损失实际情况等因素。
三、收缴非法所得与行政责任
收缴非法所得：
- 因挂靠合同无效所产生的非法所得，如管理费、不当利益等，人民法院有权依法收缴。
行政责任：
- 根据相关法律法规，挂靠方和被挂靠方均可能面临行政处罚，包括责令改正、没收违法所得、罚款、停业整顿、降低资质等级乃至吊销资质证书等。
四、协商与争议解决
协商解决：
- 对于已履行部分，双方应尽快协商解决方案，包括工程量结算、款项处理等。协商时应充分考虑双方权益，力求公平合理。
争议解决途径：
- 若协商无果或存在争议，当事人可寻求法律援助、申请调解、仲裁或提起诉讼。在此过程中，建议咨询专业律师以更好地维护自身权益。
五、后续风险防范
审查合同条款：
- 明确合同无效的具体原因，有助于责任划分和后续处理。特别是因违反法律法规导致的无效，需特别关注相关规定。
保留相关证据：
- 妥善保管与合同履行相关的所有文件、资料等证据材料，以备不时之需。
加强风险防范：
- 在未来的业务活动中，加强对合同合法性的审查和管理，建立完善的合同审核制度，加强员工培训，避免类似法律风险再次发生。
综上所述，当建工案件中的挂靠合同被认定为无效后，当事人应立即停止合同履行，并根据具体情况采取相应措施进行结算、赔偿、收缴非法所得以及承担行政责任。同时，通过协商或法律途径解决争议，并加强后续的风险防范工作。