建设施工合同因发包方不知道挂靠关系存在而无效时，处理方式主要依据工程验收情况及合同约定来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、工程验收合格的情况
折价补偿原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》第七百九十三条，建设工程施工合同无效，但建设工程经验收合格的，可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。这意味着，即使合同无效，只要工程验收合格，承包人仍有权请求发包人按照合同约定的工程价款进行折价补偿。
实际施工人的权利：
- 在挂靠关系中，实际施工人（即挂靠方）作为权利人，可以主张工程款。实际施工人可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径来主张其权利。
二、工程验收不合格的情况
修复责任：
- 如果建设工程经验收不合格，但修复后的工程经验收合格，发包人可以请求承包人承担修复费用。这意味着，承包人需要承担修复工程的费用，以确保工程最终验收合格。
无权请求折价补偿：
- 如果修复后的建设工程经验收仍然不合格，承包人无权请求参照合同关于工程价款的约定折价补偿。此时，承包人可能面临无法获得工程款的风险。
发包人的过错责任：
- 如果发包人对因建设工程不合格造成的损失有过错，应当承担相应的责任。这体现了法律对发包人过错的惩罚性，以及对承包人权益的保护。
三、处理途径
协商解决：
- 双方当事人在平等自愿的基础上，通过友好协商、互谅互让达成和解协议，进而解决纠纷。这是最为快捷、经济的解决方式。
调解解决：
- 在有关组织或中间人的主持下，在平等、自愿、合法的基础上分清是非、明确责任，并通过摆事实、讲道理，促使双方当事人自主达成协议，从而解决纠纷。调解具有灵活性和高效性。
仲裁解决：
- 纠纷当事人根据纠纷前或者后达成的仲裁协议或合同中仲裁条款向仲裁机构提出申请，由仲裁机构依法审理，作出裁决，并通过当事人对裁决的自觉履行或由一方向人民法院申请强制执行而使纠纷得以解决。仲裁具有专业性和终局性。
诉讼解决：
- 当事人通过上述途径解决不成的情况下，可以向人民法院提起诉讼，由人民法院进行判决。诉讼是最为正式、权威的解决方式，但也可能耗时较长、成本较高。
四、特别提示
- 法院不主动审查挂靠关系：在审理挂靠纠纷时，对被挂靠单位与发包人签订的施工合同的效力，未经当事人申请并举证，法院一般不主动审查。这意味着，如果发包方不知道挂靠关系的存在，且没有提出相关证据或申请，法院可能不会主动认定合同无效。
- 及时主张权利：实际施工人在发现合同无效或工程验收存在问题时，应及时主张其权利，避免超过诉讼时效或丧失其他有利时机。
建议在实际操作中，各方应严格遵守法律法规，确保合同的合法性和有效性。如果遇到合同无效或工程验收问题，应及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。