结论：旷离扣工资超过20%是否可以仲裁，需分情况讨论，但通常情况下，如果公司扣款比例超过法定或合理范围，劳动者是有权申请劳动仲裁的。
详细分析：
旷离与扣工资的法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者旷工属于违反用人单位规章制度的行为，用人单位有权依据规章制度对劳动者进行处罚，包括扣减工资。但扣减工资的比例和方式需符合法律法规的规定，不能随意扣减。
扣工资的比例限制：
- 一般来说，用人单位因劳动者旷工而扣减工资的比例，应受到法律法规的严格限制。虽然具体比例可能因地区和行业而异，但通常不会超过劳动者当月工资的20%。如果扣减比例超过这一范围，可能被视为违法扣减工资。
- 例如，如果劳动者当月工资为5000元，公司扣减超过1000元（即20%）作为旷工的处罚，那么这种扣减可能就不合法。
劳动仲裁的适用性：
- 如果劳动者认为公司扣减工资的比例过高或不合理，且与公司协商无果，那么劳动者有权向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 劳动仲裁委员会将依据相关法律法规和规章制度，对双方的争议进行调解或裁决。如果裁决结果支持劳动者的诉求，公司将被要求补发被违法扣减的工资。
实际操作建议：
- 在申请劳动仲裁前，劳动者应尽可能收集相关证据，如工资条、考勤记录、公司规章制度等，以证明自己的诉求。
- 同时，劳动者也可以咨询专业律师或法律援助机构，了解自己的权益和申请劳动仲裁的具体流程。
可能遇到的特殊情况：
- 如果公司规章制度中明确规定了旷工扣工资的比例，且该比例未超过法律法规的限制，那么劳动者可能需要接受这一扣减。但即便如此，如果扣减后的工资低于当地最低工资标准，劳动者仍有权提出异议。
- 如果劳动者旷工行为给公司造成了重大损失，公司可能会依据相关法律法规和规章制度要求劳动者进行赔偿。但赔偿金额和方式也需受到法律法规的严格限制，不能随意要求。
总结与建议：
旷离扣工资超过20%是否可以仲裁，需根据具体情况来判断。如果劳动者认为公司扣减工资的比例过高或不合理，且与公司协商无果，那么建议劳动者及时向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。同时，劳动者在申请劳动仲裁前应尽可能收集相关证据，并咨询专业律师或法律援助机构的意见。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。