公司罚款单没有公司章一般是不合法的，但需分情况讨论：

1. 从形式合法性角度
   根据《民法典》及相关司法实践，公司作出的罚款单属于单方民事法律行为，需满足形式要件才能产生法律效力。公司公章是法人意思表示的重要载体，未加盖公章的罚款单可能因缺乏形式要件被认定为无效。例如，若员工以“未加盖公章”为由主张罚款单不成立，法院可能支持其诉求。但需注意，若公司能通过其他方式（如法定代表人签字、公司系统记录等）证明罚款单的真实性，可能补正形式瑕疵。

2. 从实体合法性角度
   即使罚款单加盖公章，其合法性仍需满足以下实体要件：

• 制度依据：公司罚款需以合法有效的规章制度为依据（如经民主程序制定、公示的《员工奖惩条例》）。若制度本身违法（如罚款比例超过法定限额），则罚款单无效。
  
• 程序合规：罚款需符合法定程序（如告知员工违规事实、听取申辩、送达罚款决定等）。程序瑕疵可能导致罚款单被撤销。
  
• 金额限制：根据《工资支付暂行规定》，因员工过错造成的经济损失，公司每月扣除部分不得超过当月工资的20%。超出部分无效。

1. 特殊情形
   

• 法定代表人签字效力：若罚款单由法定代表人签字且无相反证据，可能被认定为有效（因法定代表人行为视为公司行为）。
  
• 电子化流程：若公司通过电子系统（如OA）生成罚款单，且系统记录完整、可追溯，可能被认定为有效（需符合《电子签名法》要求）。
  
• 事后追认：若员工实际履行罚款（如扣款），可能视为对罚款单的追认，但需排除胁迫、欺诈等情形。

建议：

• 对公司而言，罚款单应加盖公章或由法定代表人签字，并附制度依据、违规证据等材料，确保形式与实体合法。
  
• 对员工而言，若收到未盖章的罚款单，可要求公司补正或提出异议；若已扣款，可依据《劳动争议调解仲裁法》申请仲裁，主张返还违法扣除部分。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据材料提供针对性分析。