结论：被辞退两个月后发现怀孕了，您仍然有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益，但能否恢复劳动关系需视具体情况而定。

法律背景与解析：

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依据该法的第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这一规定旨在保护女性职工在特殊时期的就业权益，确保她们不会因生理原因而遭受不公平的待遇。

情况分析：

1. 若辞退行为发生在怀孕前，但您能证明辞退与怀孕无关：

   • 在这种情况下，由于辞退行为发生在您怀孕之前，且您无法证明辞退与怀孕有直接关联，那么恢复劳动关系的难度会相对较大。但您仍然可以申请劳动仲裁，要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金的计算方式为经济补偿标准的二倍，具体数额根据您在本单位工作的年限来确定。

2. 若辞退行为发生在怀孕后，或虽发生在怀孕前但您能证明辞退与怀孕有关（如用人单位在得知您怀孕后辞退）：

   • 在这种情况下，用人单位的行为明显违反了《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定。您有权申请劳动仲裁，要求恢复劳动关系。如果仲裁委员会认定用人单位的行为违法，那么用人单位必须依法继续履行劳动合同。
   • 同时，您也可以选择不要求继续履行劳动合同，而是要求用人单位支付赔偿金。赔偿金的计算方式同样为经济补偿标准的二倍。

申请仲裁流程与注意事项：

1. 提交仲裁申请书：您需向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并附上相应副本。申请书中应详细列明双方的基本信息、仲裁请求、事实及理由、证据和证据来源等。

2. 仲裁受理与审查：仲裁委员会将在收到申请后五日内进行审查，符合受理条件的将正式受理，并通知您；不符合条件的，将书面说明理由并通知不予受理。

3. 开庭审理与调解：仲裁庭会提前五日通知开庭日期和地点。在开庭前，仲裁庭会尝试进行调解，若调解成功，将制作调解书并经双方签收后生效；若调解不成或一方反悔，仲裁庭将及时作出裁决。

4. 仲裁裁决与执行：仲裁庭应在受理申请之日起四十五日内结束案件审理，复杂情况可经批准延期，但延长期限不得超过十五日。裁决作出后，双方应履行裁决结果，否则可申请强制执行。

证据收集与建议：

• 在申请仲裁过程中，您应特别注意收集相关证据，如劳动合同、工资条、辞退通知书、工作证、医疗证明（证明怀孕事实）等，以证明用人单位的违法行为。
• 同时，建议您保持冷静、理性，并遵循正确的法律程序。如果您对仲裁流程或法律条款有疑问，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。

后续行动建议：

• 在申请仲裁的同时，您也可以考虑与用人单位进行协商，看是否能够达成和解协议，以更快地解决问题。
• 如果仲裁结果不如您意，您还可以在规定期限内向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

总之，被辞退两个月后发现怀孕了，您仍然有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。但能否恢复劳动关系需视具体情况而定，建议您根据自身情况选择合适的维权方式。