结论：合同上写着奖金500元，但实际发放时只发了350元，这一行为是否合理，需根据具体情况来判断，一般情况下，若合同有明确约定且无合法变更理由，则不合理。以下从不同角度进行分析：
一、合同约定角度
合同具有法律约束力：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。因此，如果合同中明确约定了奖金为500元，那么用人单位应当按照合同约定发放。
合同变更需双方协商一致：如果用人单位想要变更奖金数额，应当与劳动者协商一致，并签订书面变更协议。未经劳动者同意，用人单位单方面降低奖金数额，可能构成违约行为。
二、实际发放情况角度
实际发放与合同约定不符：如果用人单位实际发放的奖金数额与合同约定不符，且没有合法合理的理由（如劳动者存在严重违反规章制度等行为导致奖金扣减），那么这一行为可能构成违约。
劳动者有权要求补足差额：在这种情况下，劳动者有权要求用人单位按照合同约定补足奖金差额。如果用人单位拒绝补足，劳动者可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
三、特殊情况考虑
合同存在模糊条款：如果合同中关于奖金的条款存在模糊或不明确的地方，导致双方对奖金数额存在争议，那么需要根据合同的整体内容、双方交易习惯以及诚实信用原则等进行解释和判断。
用人单位存在合法扣减理由：如果用人单位能够证明劳动者存在严重违反规章制度、给用人单位造成重大损失等合法扣减奖金的理由，并且这些理由在合同或规章制度中有明确规定，那么用人单位可能有权扣减部分奖金。但即便如此，扣减的数额也应当合理，并且需要符合相关法律法规的规定。
四、建议与行动
与用人单位沟通：首先，建议劳动者与用人单位进行沟通，了解奖金扣减的具体原因，并要求用人单位提供相关的证据和依据。
收集证据：如果沟通无果，劳动者应当收集相关证据（如合同、工资条、奖金发放记录等），以证明用人单位存在违约行为。
寻求法律援助：如果劳动者认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并探讨可能的维权途径。
最后，合同上写着奖金500元，但实际发放时只发了350元，这一行为是否合理需根据具体情况来判断。如果合同有明确约定且无合法变更理由，则用人单位的行为可能构成违约。在这种情况下，劳动者有权要求用人单位补足奖金差额，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。如果你有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。