结论：自动离职时，员工对于其已付出的劳动部分有权获得相应的工资报酬，但特殊情况下，如给用人单位造成损失或违反相关约定，可能会有所扣除。以下是对这一问题的详细分析：
一、正常情况下的工资支付
工资支付原则：
- 根据《劳动法》及《劳动合同法》的相关规定，劳动者付出劳动后，享有获得劳动报酬的基本权利。无论劳动者因何种原因离职，只要其按照用人单位的要求提供了劳动，用人单位就应当按照劳动者实际工作的天数和双方约定的工资标准，支付相应的工资。这包括基本工资、绩效工资（若有）、加班工资等各项应得收入。
工资计算方法：
- 日工资一般为月工资收入除以月计薪天数（通常为21.75天）。例如，若某员工月薪为5000元，当月工作了15天后自动离职，则用人单位应当支付其约3448.28元（按月薪5000元除以月计薪天数21.75天，再乘以实际工作天数15天计算）。
二、特殊情况下的工资处理
给用人单位造成损失需赔偿：
- 若劳动者的自动离职行为给用人单位造成了经济损失，如未按规定办理工作交接导致生产经营受影响或财物丢失损坏等，用人单位有权要求劳动者赔偿相应损失。
- 赔偿金额可从劳动者工资中扣除，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 用人单位需有充分证据证明损失数额，并确保扣除程序和金额符合法律规定。
违反服务期或竞业限制约定：
- 若劳动者与用人单位签订了服务期协议或竞业限制协议，并在自动离职时违反了相关约定，劳动者可能需按协议约定支付违约金。
- 违约金的数额由双方在协议中约定，但不得超过用人单位提供的培训费用或劳动者违反竞业限制约定给用人单位造成的损失。
- 用人单位同样需确保违约金的扣除符合法律规定，并提供相应证据。
三、工资支付时间
- 用人单位应在与劳动者约定的工资支付日期支付自动离职前的工资。若没有约定，用人单位应在解除或终止劳动关系之日起三个工作日内一次付清劳动者工资。
四、维权途径
- 若用人单位拒绝支付自动离职员工的工资或存在其他违法行为，劳动者可通过以下途径维护自身权益：
- 首先尝试与用人单位协商沟通，明确工资数额及支付时间；
- 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，并提供相关证据；
- 如劳动监察部门未能及时解决问题，可向劳动仲裁机构申请仲裁；
- 若劳动仲裁裁决后用人单位仍不履行义务，可向人民法院提起诉讼。
总结：自动离职的员工对于其已付出的劳动部分享有获得工资的权利，用人单位应依法支付工资，并在特殊情况下合理处理赔偿或违约金问题。劳动者也应了解自身权益和维权途径，以确保自身合法权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。