在农村自建房中，若儿子全部出资而父母负责监管建设，房屋的占有比例并非由出资或监管行为直接决定，而是需综合考虑多种因素，包括但不限于出资情况、建设过程中的贡献、房屋登记情况以及各方之间的约定等。以下是对此问题的详细分析：

一、出资情况与占有比例

1. 出资是重要因素：儿子作为全部出资人，在房屋建设过程中承担了主要的经济责任。这通常会被视为对房屋所有权的重要贡献，因此在确定占有比例时，儿子的出资情况是一个重要的考量因素。

2. 出资不直接决定比例：然而，出资并不直接等同于房屋的占有比例。因为房屋的建设不仅涉及资金投入，还包括土地使用、建设规划、施工管理等多个方面。父母虽然未直接出资，但他们的监管行为对房屋的建设质量和进度可能产生了重要影响。

二、建设过程中的贡献与占有比例

1. 父母的监管贡献：父母在房屋建设过程中负责监管，这包括了对施工质量的监督、进度的把控以及与施工方的沟通协调等。这些工作对于房屋的顺利建成至关重要，因此父母的监管贡献也应被纳入占有比例的考量范围。

2. 综合考量贡献：在确定占有比例时，应综合考量儿子和父母在房屋建设过程中的各自贡献。这包括出资情况、监管行为、土地使用权的归属（如果涉及）以及各方之间的约定等。

三、房屋登记情况与占有比例

1. 登记具有公示效力：房屋的登记情况是确定所有权的重要依据。如果房屋登记在儿子名下，那么从法律上讲，儿子是房屋的所有权人。但这并不意味着父母没有权益，因为他们的监管行为可能构成了对房屋的共有或债权关系。

2. 登记与实际权益可能不一致：在实际操作中，房屋的登记情况可能与各方的实际权益不一致。例如，父母可能基于出资、监管或其他原因对房屋享有部分权益。在这种情况下，需要通过法律途径来明确各方的权益比例。

四、各方之间的约定与占有比例

1. 约定优先：如果儿子和父母之间就房屋的占有比例有明确的约定，那么该约定应优先于其他因素进行考虑。因为约定是各方真实意思的表示，具有法律约束力。

2. 无约定时的处理：如果没有明确的约定，那么需要根据出资情况、建设过程中的贡献以及房屋登记情况等因素来综合确定占有比例。在这种情况下，可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议。

五、法律建议

1. 明确约定：为了避免未来的争议，建议在房屋建设前或建设过程中，儿子和父母之间就房屋的占有比例、权益分配等事项进行明确约定，并签订书面协议。

2. 咨询专业律师：如果各方对房屋的占有比例存在争议，且无法通过协商解决，建议咨询专业律师以获取法律帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见，并协助各方通过法律途径解决争议。

总结来说，农村自建房中儿子全部出资而父母负责监管建设时，房屋的占有比例需综合考虑出资情况、建设过程中的贡献、房屋登记情况以及各方之间的约定等多种因素。在确定占有比例时，应遵循公平、合理的原则，并尽可能通过协商或法律途径来明确各方的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。